DNA 实验

用牙签从琼脂培养基上挑取的菌落可直接用于制备质粒 DNA。所得的闭合环状 DNA 往往杂质太多，不能作为大多数限制酶的底物。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。

DNA的连接和酶切可用于：（1）利用限制性核酸内切酶切割DNA和利用DNA连接酶连接DNA是DNA重组过程中的关键步骤之一；（2）成功的酶切和有效的连接为后续的外源基因进入宿主细胞进行表达提供了有效的实验材料。

本实验包含了用于制备适用于双脱氧测序的模板及适用于末端标记和化学测序的DNA的实验方案。所有用于双脱氧测序的双链模板在与引物退火前必须变性，在一般应用上，碱变性在测序中的效果比热变性好。

在基本的双晩氧测序反应中，寡核苷酸引物退火于单链DNA摸板，在4种脱氧核糖核酸三磷酸存在时，引物为DNA聚合酶所延伸。反应混合物中也含有4种双脱氧核糖核苷三磷酸的其中一种，当它掺入到DNA的生长链时，可终止链的延伸。

标准的双脱氧DNA测序可以很容易和很有效地使用非同位索标记的化学发光法进行检测。在测序反应中，使用生物素标记的引物。用非同位素标记如生物素衍生化的引物，可用于为5’-末端标记引物而设的入测序反应的工作方案。

Linker scanner mutations （接头分区突变）：体外在限制性片段加上位点，使两个DNA分子发生重组产生，结果在重组的位点加上连接序列。

用小鼠L型成纤维细胞来进行条件优比的，但只需稍做修改即可适用于几乎任何细胞。根据所研究的细胞类型进行方法优化十分关键。

YAC带有天然染色体所有的功能元件，包括一个着丝粒，一个DNA复制起点，两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA，这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因，在染色体步移中每次允许更大的步移距离，同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。

所谓探针，一般是指用来检测某一特定核苷酸序列或基因序列的DNA片段或RNA片段。但要使探针DNA片段能实际应用，必须使DNA或RNA分子带上可识别的信号标志，以便跟踪观察探针与其同源的核苷酸序列发生杂交反应的位置，被探测DNA或RNA片段上的大小、杂交信号的强弱等。目前应用最多的是核素标记方法或非核素标记方法。

冻融法回收DNA片段可用于：（1）获取纯化的DNA片段；（2）回收PCR产物。

SSR简单序列重复标记可以用于：用微卫星区域特定顺序设计成对引物，通过PCR技术，经聚丙烯酰胺凝胶电泳，即可显示SSR位点在不同个体间的多态性。

化学法测定DNA含量可以用于：（1）转化、转染之前的质粒浓度估测；（2）对获取的DNA含量进行检测。

基因转染技术可以应用于：基因组功能研究（基因表达调控，基因功能，信号转导和药物筛选研究）和基因治疗研究。

地高辛系统是过提供的另一种非同位素标记方法，其检测方法是通过偶联上一种或数种荧光染料或酶的抗地高辛抗体，或用间接免疫荧光来测定。

放射性同位素标记的DNA序列测定分析可应用于分析基因结构与功能关系。

聚合酶链反应构建重组DNA用途广泛（1）用于测序引物（2）定点突变（3）核酸杂交探针（4）PCR引物。

T4 DNA 聚合酶具依赖人为模板的聚合酶活性，同时具有对单链、双链DNA的3’到5’端的外切酶活性，缺少5’到3’端的外切酶活性。

Klenow酶是大肠杆菌八聚合酶I的羧基端片段，它具有DNA聚合酶和3’到5’方向的外切酶活性，不含5’到3”方向的外切酶活性。

主要用于显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。

杂交分析的原理是特定序列的单链DNA分子（即通常标记的“探计”）可与另一个固定了的具有互补序列（“靶”序列）的DNA分子或RNA分子形成碱基配对，杂交分子的稳定性取决于发生碱基配对的程度，这一技术可检测复杂基因组中的单拷贝基因。