DNA 实验

核酸电泳是进行核酸研究的重要手段，可以用于：（1）核酸探针；（2）核酸扩增；（3）序列分析等技术。

斑点和狭线印迹实验，可用于检测被印迹的1DNA制品中靶序列的相对丰度。主要应用（1）遗传病诊断；（2）DNA图谱分析；（3）检测样品中的DNA及其含量；（4）PCR产物分析。

沉淀DNA的实验可应用于分离DNA。

DNA定点突变可用于：（1）研究蛋白质相互作用位点的结构、改造酶的不同活性或者动力学特性；（2）改造启动子或者DNA作用元件；（3）提高蛋白的抗原性或者是稳定性、活性、研究蛋白的晶体结构，以及药物研发、基因治疗等等方面。

在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素，以保证DNA的完整性，为后续的实验打下基础。一般真核细胞基因组DNA有107-9bp，可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取，常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞，随后用酚抽提而实现的。

利用基因组DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。在提取过程中，染色体会发生机械断裂，产生大小不同的片段，因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作，如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓， 以保证得到较长的DNA。

碱裂解法提取质粒DNA的基本原理是溶液Ⅰ使细胞悬浮并且EDTA可以与Ca2+ 和Mg2+ 螯和，抑制DNase的活性，溶液II裂解细菌，变性蛋白质和少量质粒，溶液Ⅲ使大部分蛋白质与细菌基因组DNA一起被共沉淀，质粒DNA复性。此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切PCR 扩增。

M13噬菌体是一种丝状噬菌体，感染宿主后不裂解细菌细胞，只利用细胞内物质完成自身增殖，组装成完整病毒颗粒后被宿主细胞分泌而出，宿主细胞仍能继续生长分裂。为分子生物学中理想的质粒载体。基因间隔区的有些核苷酸序列即使发生突变、缺失活插入外源DNA片段，也不会影响M13DNA的复制，这为M13DNA构建克隆载体提供了条件。

用碱和SDS处理可以大规模的细菌培养物中分离质粒DNA，所获得的质粒则可通过柱层析或CsCl- 溴化乙锭梯度离心进一步纯化。了解质粒的特性及其在分子生物学研究中的作用；掌握质粒DNA分离和纯化的原理；学习碱裂解法和煮沸法分离质粒DNA的方法。

DNA文库的构建和筛选可以用于：（1）将某生物的全部基因组DNA用限制性内切酶或机械力量切割成一定长度的DNA片段，再与适合的载体在体外重组并转化相应的宿主细胞获得的所有阳性菌落。 （2）采用“化整为零”策略，将庞大的基因分解成一段段，每段包含一个或几个基因。

cDNA文库构建可以：（1）用于分离全长基因进而开展基因功能研究；（2）筛选目的基因并直接用于表达；（3）提供构建分子标记连锁图谱的所用探针。

Southern blot可应用于：（1）检测重组DNA；（2）分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段；（3）验证检测片段的分子量大小。

核酸探针分子杂交是指具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下可按碱基互补原则形成双链，此杂交过程是高度特异的。核酸探针根据核酸的性质，可分为DNA和RNA探针；根据标记物不同，可分为放射性标记探针和非放射性标记探针两大类；根据是否存在互补链，可分为单链和双链探针；根据放射性标记物掺入情况，可分为均匀标记和末端标记探针。

DNA纯化可用于：（1）获得高纯度的DNA；（2）浓缩DNA；（3）测序、遗传信息分析等分子生物学应用。

细菌基因组DNA提取可应用于：（1）获得细菌基因组DNA；（2）作为PCR模板；（3）用于测序、遗传信息分析等。

非显带染色体除可根据形态分辨部分染色体，其他多数染色体难以确认，而显带技术则可使染色体纵向长度上出现不同带纹，以辨认全部染色体。GTG即G 带，Trypsin（胰酶），Giemsa的简写。Giemsa染料是噻嗪——曙红染料，染色体的着色有赖于在原位形成噻嗪--曙红（2∶1）的沉淀物。

异染色质在整个分裂间期及分裂期都是浓缩的，因而其大小较为恒定。它们通常位于着丝粒附近，或在染色体臂上呈现“团块”，这些染色质主要由C显带技术呈 现，故称为C带。CBG即C带、Ba（OH）2、Giemsa的简写。C带的根本特征是选择性地从染色体臂抽取DNA，但在C带区有很强抗性，仍保留大部 分DNA，Giemsa染色后可见效果良好的C带。

RNA的甲醛变性电泳可以用于：（1）提取样品的总RNA后，一般根据RNA的凝胶电泳图来判断RNA的质量；（2）由于RNA容易形成二级结构，因此常用甲醛变性胶来进行RNA电泳，得到的电泳图能真实反映RNA的质量状况。

DNA测序可用于：（1）测定未知序列；（2）确定重组DNA的方向与结构；（3）对突变进行定位和鉴定比较研究。

来源：《分子细胞遗传学技术与应用》