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DNA 测序

实验分类:

DNA 实验

最新修订时间:

简介

DNA测序可用于:(1)测定未知序列;(2)确定重组DNA的方向与结构;(3)对突变进行定位和鉴定比较研究。

来源:丁香实验

操作方法

自动测序法

一、准备工作 1. BigDye测序反应试剂盒 主要试剂是BigDye Mix,内含PE专利四色荧光标记的ddNTP和普通dNTP,AmpliTaq DNA polymerase FS,反应缓冲液等。 2. pGEM-3Zf (+) 双链DNA对照模板 0.2 g/L,试剂盒配套试剂。 3. M13(-21)引物 TGTAAAACGACGGCCAGT,3.2 umol/L,即3.2 pmol/

双脱氧链末端终止法

一、试剂与器材准备 1. 试剂 (1)退火缓冲液:1 mol/L Tri-HCl(pH7.6),l00 mmol/L MgCl2 和160 mmol/L DTT。 (2)通用测序引物:5'-d[CGTAAAACGACGGCCAGT]-3',在水溶液中(5 pmol/ul)。 (3)T7DNA聚合酶(8 ug/ul):在加有甘油的缓冲液中,应储于-20℃,用时吸取1份后迅速放回。稀释液可在

非同位素银染

一、试剂准备 1. SILVER SEQUENCETM DNA测序试剂盒。 2. 丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺储备液(38%丙烯酰胺 W/V,2%甲叉双丙烯酰胺 W/V):95 g丙烯酰胺,5 g甲叉双丙烯酰胺溶于140 ml 双蒸水中,定容至250 ml,0.45 mm过滤器过滤后,贮于棕色瓶中,置于4℃冰箱可保存2周。 3. 10%过硫酸铵,0.5 g过硫酸铵溶于4 ml水中,定容至5 m

鸟枪法

一、用限制酶切下目的片段的大片段InsertDNA,并用Agarose凝胶电泳进行回收。 二、对回收的大片段DNA用物理方法(如超声波等)进行切断处理,然后用T4DNAPolymerase对小片段DNA进行末端平滑化。 三、进行Agarose电泳,切胶回收1kbp~2kbp的小片段DNA。然后用BcaBestDNAPolymerase在DNA的3'端加上一个A碱基。 四

Maxam-Gilbert化学修饰法

一、取待测DNA片段,既可以是单链也可以是双链。 此法又叫化学切割法,或化学降解法,切割之前先对待测片段作末端标记。用放射性P32-磷酸集团标记链的末端之一。 二、将标记完的样品,分成四份。分别采用不同的化学试剂对所得样品,进行修饰进而切割(切割就是利用特异的化学试剂,修饰DNA分子中不同的碱基,使被修饰的碱基之间的连接变得不稳定,发生断裂,而产生各种长度的DNA片段。)

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