PCR 技术

这一实验方案分为 6 个阶段。第 1 阶段：降解 RNA 的去磷酸化; 第 2 阶段：完整 RNA 去帽; 第 3 阶段：RNA 寡核苷酸的制备; 第 4 阶段：RNA 寡核苷酸与细胞 RNA 的连接; 第 5 阶段：反转录; 第 6 阶段：扩增。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

使用合成的寡核苷酸构建文库时，PCR 有两个重要的作用。第一，用与特定侧翼序列退火的引物来扩增文库，仅用少量的不同模板，就可以得到大量的 PCR 产物。第二，若要产生文库 DNA 的复杂互补链，PCR 合成法是有效的方法。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

这一实验方案分为 3 个阶段。 第 1 阶段：反转录产生 cDNA 模板 ；第 2 阶段：在第一链 cDNA 产物末端加 poly(A) 尾 ；第 3 阶段：扩增。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

本实验介绍用经典 RACE 扩増 3'末端 cDNA 的方法。PCR 实验指南，章节25.4,方案1

本实验介绍基于 PCR 的 DNA 文库筛选方法。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

为了确认所选择 cDNA 确实是差异表达的，建议使用 Northern 印迹分析，而不要用其他的确认技术，比如反向 Northern 杂交（Zhangetal.1996) 或定量 RT-PCR。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

从丙烯酰胺凝胶上切下潜在的差异表达 cDNA 之后，用同一种锚定-任意引物组合重新扩增 cDNA, 反应条件与最初 PCR 相同。重新扩增的产物，可以进行克隆和测序，以供进一步分析。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

本方案设计为 24 个 PCR 反应，使用 3 种 cDNA 亚群（利用方案 3 中的 H-T11M 引物进行 RT 反应），引物为荧光染料标记的锚定引物（FH-T11M) 与 24 种上游任意引物 (HAP) 的组合。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

cDNA 合成反应的体积，依赖于所用的锚定-任意引物组合的数目。下面提供的方案，适用于 24 个引物组合和两个样品。对于更多的样品和/或更多的引物组合，调整相应主体混合液的体积。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

为了进行 FDD 基因表达的分析，以及使用任何其他基于 RNA 的基因表达技术，在反转录合成单链 cDNA 和后续的 PCR 操作之前，必须除掉污染的基因组 DNA。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

虽然 FDD 利用了真核 mRNA 的多聚腺苷酸 [poly(A)+] 位点，但并不推荐使用 poly(A)+RNA，因为在反转录反应中可能污染寡核苷酸，并因此增加假阳性的概率。所以建议使用总 RNA 做 FDD 分析。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

下面 4 个探针用于差异筛选杂交。 1. 检测者特异性消减探针（正向消减探针）。 2. 驱动者特异性消减探针（反向消减探针）。 3. 从检测者 mRNA(或检測者基因组 DNA) 直接合成的 cDNA 探针。 4. 从驱动者 mRNA(或驱动者基因组 DNA) 直接合成的 cDNA 探针。 本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

对于高通量的筛选，推荐使用几个热循环仪厂家提供的 96 孔或 384 孔 PCR 板，或者使用单个的管子。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

SSH 的主要缺点是，在消减文库中存在代表非差异表达 DNA 种类的背景克隆。在某些情况下，背景克隆的数量可能大大超过目的克隆。为了克服这个问题，推荐镜像方向选择(MOS)。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

在本方案所描述的反应中，差异 DNA 被选择性地扩增。每个实验至少应该有 4 个反应：①已消减的检测 DNA;②未消减的检测者对照（1-c);③反向消减的检测 DNA;④反向未消减的对照（2-c)。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

实验介绍消减杂交，本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

一次双向消减，需要总量为 2ug 的基因组 DNA 或 cDNA。大多数分离 RNA 和基因组DNA 的方法都适用于本实验（Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

本实验介绍使用 HC ExpressArray Kit 进行杂交与检测的方法。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

本方案描述了通过 PCR 扩增产物，来制作 cDNA 微阵列的实验步骤。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。

这一部分介绍了一种原位 PCR，特别是逆转录酶原位 PCR 的简略方法。详细讨论了其中的每个实验程序。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。