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问
公司定的pcr引物如何验证是否合适?
丁香清香
可以用于正式实验的引物必须满足以下条件:a溶解曲线单峰,窄而尖,否则可能有非特异性扩增;峰的位置横坐标一般在80度以上,这个温度为PCR产物的解链温度,如果在75度附近,可能是引物二聚体,miRNA染料法检测时,溶解曲线的峰的位置可能在75度附件b琼脂糖电泳为明亮的一条带,条带一般在100bp以上,如果设计引物时PCR产物在100bp一下,需要仔细辨认是否为引物二聚体;引物二聚体的条带一般在50b
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问
PCR求助赐教
帝尊
勤换枪头,严格按操作流程操作,及时保养。
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问
怎么用qpcr来检测病毒的滴度呢,样品是293t细胞产生的病毒,需要怎么处理吗?
汤姆卜丽波
通过在载体的长末端重复序列区(LTR)设计定量引物,利用荧光实时定量PCR测定重组慢病毒中LTR拷贝数来测定病毒颗粒数和有效感染的病毒颗粒,通过慢病毒颗粒数与实际有活力病毒滴度的比较,可以计算得到重组慢病毒感染效率.
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问
qpcr的引物应该有什么网站或者工具可以检查它的扩增效率吗?每次设计的都不太好用
balalaLy
引物设计的软件在设计过程中就有引物质量的评价反馈,也可以到pubmed上blast一下
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问
384孔板,rt-qpcr实验结果的处理?
balalaLy
跟96孔板的处理一样啊,只是工作量大了而已
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问
为什么细菌的16s用KOD酶有时候跑不出来,同样的条件taq酶可以呢
bamboopiggy
kod是高保真的酶,不会产生错配,但是效率有点低,taq酶保真性差,但是扩增能力强。
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问
在进行线粒体DNA PCR扩增时用限制酶酶切有什么作用,除了分段,获得目的的DNA还有别的吗?
bamboopiggy
不知道你的实验目的,但是一般酶切就是为了分开或者验证什么。
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问
乙肝病毒荧光定量多少正常?
汤姆卜丽波
乙肝病毒荧光定量也就是PCR检测,正常值小于100IU/ml,如果大于100IU/ml,就是阳性的结果,也就是携带了乙肝病毒。
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问
荧光定量pcr检测解脲支原体dna阳性说明什么?
秋秋欣欣
解脲支原体阳性,提示存在解脲支原体的污染
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问
怎么确定很好的荧光定量PCR的引物,具体看哪些参数进行区分呢?
汤姆卜丽波
引物最好位于编码区5’端的300-400bp,无二级结构(自由能小于58.61KJ/mol),长度一般在17-25碱基之间,G+C含量45-55%,TM58-62
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问
请问克隆引物和qPCR引物有什么区别,可以用qPCR引物做基因克隆用吗?
bamboopiggy
看你的实验目的,克隆的引物一般是在基因的起始和结尾设计,但是qPCR的引物的产物一般是50-200bp左右的,如果你要克隆50-200bp左右的片段,就可以用qPCR的引物。
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问
请问qPCR引物合成出来大概多久内要用完?怎么样验证一下我放了很久的qPCR引物是否还可以用?
天一湖医者
如果放入-20度的话,可以一年。
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问
请问我的目的基因的本身GC含量就比较高,该怎么样设计克隆引物?
秋秋欣欣
克隆引物就正常设计就可以,退火温度可稍微设置高一点
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问
荧光定量的标准曲线是否是必需的?
天一湖医者
荧光定量的标准曲线是非常必需的。
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问
qPCR曲线形状解释
汤姆卜丽波
模板浓度太高了,在基线期内就起峰了,仪器会默认起峰的线条仍为基线部分,将扩增曲线往基线位置下拉,因此你的曲线下滑,这种情况大家也不要慌,可以减小基线终点(例如基线期默认 3 - 15 个循环,改为 3 - 10 个循环),重新分析数据,一般都能得到一个比较好的结果
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问
PCR条带弥散严重,怎么解决呢?
天一湖医者
1.酶量过高。减少酶量;酶的质量差,调换另一来源的酶。2.dNTP浓度过高。减少dNTP的浓度。3.MgCl2浓度过高。可适当降低其用量。4.模板量过多。质粒DNA的用量应<50ng,而基因组DNA则应<200ng。
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问
1.引物二聚体严重是怎么回事?2.CT值偏大(CT值的大于等于30)是什么原因呢?3.体系双扩增的原因?
天一湖医者
引物设计不合理,两条或一条引物的3`端有互补序列,造成自己配对延伸而扩增。建议重新设计引物,,或者降低退火温度、增加模板和引物的量试下。
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问
无特异性扩增,全为引物二聚体是怎么回事?
李小栋UI65
引物效果不好可能是由于引物间存在互补序列
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问
PCR求助
bamboopiggy
你这不是正常的melt curve,数据不能用了。找一下原因,是试剂还是机器的原因。
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问
UCSC验证别人已发表文献的引物出现no match,什么原因?
bamboopiggy
是不是方向问题?有的软件要求reverse方向的引物要反向互补才能对比上
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