RNA 实验

寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解实验是分析 RNA 蛋合复合物（RNP，核糖核蛋白颗粒）的方法，无论是对于粗提物还是提纯后的样品，对分析 RNP 的结构域的结构都非常有效。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

本方法可从 100 只果蝇或约 2g 果蝇胚胎中制备 RNA。

聚丙烯酰胺共电泳（poiyacrylamide coelectrophuresis，PACE ) 检测是相对较晚发展起来的定量分析蛋白质、肽与 DNA 或 RNA 相互作用的方法。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

酵母三杂交系统（yeast three-hybrid system）可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中，RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录，可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库（融合蛋白的 N 端由载体序列编码，C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码），进而诱导融合蛋白表达，并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤膜上，以标记的 RNA 探针进行筛选，最终获取能与靶 RNA 分子特异性结合蛋白质的 cDNA。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 mRNA 的相互作用调控基因的表达。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

盐酸胍可在裂解细胞的同时快速抑制 RNA 酶的活性，本方法利用这特点来分离果蝇 RNA

可从酵母细胞提取质量良好的总 RNA.

通过 DEAE 纤维素柱纯化，除去少量 DNA、大分子 RNA、蛋白质、多糖等杂质，最后得到各种氨基酸专一性 tRNA 的混合物.

从各种不同的真菌中提取总RNA。

真核生物前体 mRNA ( pre-mRNA ) 的剪接分为两步，即先从前体切去内含子，然后将两个外显子连接在一起形成成熟的 mRNA。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

细胞的环境、复制周期的状态和分化状态的改变会引起一些 mRNA 半衰期的改变。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

胞核提取物可以用于前体 mRNA 的剪接，S100 提取物中虽然包括许多剪接因子，但它不具有剪接活性，因为它只含有剪接所必需的部分 SR 蛋白，不过该提取物中补充一种或多种 SR 蛋白后就可以进行有效的剪接。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

前体 mRNA ( pre-mRNA ) 剪接因子 SR（serine/argininc rich，富含丝/苏氨酸）蛋白家族是将剪接体组装到前体 mRNA 上的重要参与者。SR 蛋白是重要的剪接因子，该家族的不同成员可以在体外或体内指导选择性剪接位点的选择。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

RNA 也可以由线状 DNA 为模板，通过 RNA 聚合酶（如T3、T7 或 SP6 ) 在体外合成。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

剪接体 ( spliccosome ) 是真核生物中从初级转录物中切除内含子的催化单位。剪接体包含 U1、U2、U4/U6、U5 snRNP 等 4 种小核糖核蛋白颗粒（snRNP ) 和大量的非 snRNP 蛋白。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

RNA 干涉（RNA1） 是指在真核细胞中引入双链 RNA ( doubt-stranded RNA，dsRNA ) 分子从而导致具有序列同源性的基因产生特异件基内沉默（gene silencing ) 的现象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外，还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA（noncoding RNA，ncRNA），非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用，如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达，还有一部分则起着调控基因表达的作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

随机RNA文库的SELEX筛选实验可用于：（1）体外诊断；（2）体内治疗等。