随机引物 适用于长的或具有发卡结构的 RNA。适用于 rRNA、mRNA、tRNA 等所有 RNA 的反转录反应。主要用于单一模板的 RT-PCR 反应。 Oligo dT 适用于具有 PolyA 尾巴的 RNA。(原核生物的 RNA、真核生物的 Oligo dT rRNA 和 tRNA 不具PolyA 尾 巴。)由于 Oligo dT 要结合到 PolyA 尾巴上,所以对 RNA 样品的质量要求较高,即使有少量降解也 会使全长 cDNA 合成量大大减少。 基因特异性引物 与模板序列互补
A = B(1+e) n A=amplified products, B=input templates, n=cycle number, and e=amplification efficiency. Factors affecting amplification efficiency in the RT-PCR process include the efficiency of reverse
性由两个人工合成的引物序列决定。反应分三步: A.变性:通过加热使 DNA 双螺旋的氢键断裂,形成单链 DNA; B.退火:将反应混合液冷却至某一温度,使引物与模板结合。 C.延伸:在 DNA 聚合酶和 dNTPs 及 Mg2+存在下,退火引物沿 5‘ —— 3’ 方向延伸。 以上三步为一个循环,如此反复。 3. 逆转录酶和 RT-PCR 逆转录酶(reverse transcriptase)是存在于 RNA 病毒体内的依赖 RNA 的 DNA 聚合酶,至少具有以下三种活性: (1)依赖 RNA
一、总RNA提取1. 取200mg组织,放到1.5mlEP管中,加入1mlTrizol剪碎。2. 震荡30s。3. 加0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min。4. 12000×g,4℃离心,15min。5. 吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。6. 加等体积异丙醇,-20℃,30min。7. 12000×g,4℃离心,10min。在管底部可见微量RNA沉淀8. 弃上清,加75%乙醇1ml,振荡。9. 7500×g,4℃离心,10min。10. 弃上清,用滤纸小心吸取残留液体