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反转录 RT-PCR 实验进阶
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相对 RT-PCR: 样品定量实验
已知线性范围的循环参数和 18SrRNA 引物与竞争子的比例,就可以用自己的样品去做相对定量 RT-PCR。下面配制的 PCR 反应混合物包含 9 个反应(4 个样品、4 个非反转录对照、1 个不加模板的对照)及 10% 的额外份额。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
实验概况收录 1 操作方法 · 3 相关问答 · 3 相关文章
竞争性 RT-PCR: 拷贝数的评估
在预实验中,对样品和竞争子应分别做反转录,然后,不变的这种样品反转录产物的量与竞争子反转录产物 2 的对数倍稀释的量相结合,用于 PCR,这种方法可以确定样品的最适拷贝数。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
实验概况收录 1 操作方法 · 3 相关文章
RT-PCR技术
提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA,再以cDNA为模板进行PCR扩增,从而获得目的基因或检测基因表达。
操作方法所属实验:逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR,rtpcr)
实时 RT-PCR 实验
min,以使 DNA 酶 I 失活。2.每次进行 RT-PCR(20ul) 时,PCR 管应放在冰上混合各种成分。逬行多个反应时除了 RNA, 可以把所有的试剂混在一起,然后分装。反应条件:25°C 孵育10min,42°C 保持 30~50 min,70°C 再保持 15 min, 最后在冰上冷却。3.反转录完成后,最好加入 1ulRNA 酶 H,37°C 孵育 20 min 以消化剩余的 RNA。用上面所述的Platinum Quantitative PCR Super Mix-UDG 反转
操作方法所属实验:实时 RT-PCR 实验
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RT-PCR 引物的选择

随机引物 适用于长的或具有发卡结构的 RNA。适用于 rRNA、mRNA、tRNA 等所有 RNA 的反转录反应。主要用于单一模板的 RT-PCR 反应。 Oligo dT 适用于具有 PolyA 尾巴的 RNA。(原核生物的 RNA、真核生物的 Oligo dT rRNA 和 tRNA 不具PolyA 尾 巴。)由于 Oligo dT 要结合到 PolyA 尾巴上,所以对 RNA 样品的质量要求较高,即使有少量降解也 会使全长 cDNA 合成量大大减少。 基因特异性引物 与模板序列互补

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定量RT-PCR (Quantitative RT-PCR

A = B(1+e) n A=amplified products, B=input templates, n=cycle number, and e=amplification efficiency. Factors affecting amplification efficiency in the RT-PCR process include the efficiency of reverse

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应用mRNA反转录扩增cDNA(RT-PCR
RT-PCR技术可应用于:(1)构建大容量cDNA文库;(2)鉴 定已转录序列是否发生突变及呈现多态性;(3)测定基因表达的强度。
实验概况收录 1 操作方法 · 3 相关文章
竞争性 RT-PCR: 竞争子 RNA 的构建实验
第一部分:竞争子的设计;第二部分:竞争子RNA的合成、纯化和定量。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
实验概况收录 1 操作方法 · 3 相关文章
相对 RT-PCR: 样品定量实验
可以用来比较样品间模板 RNA 的相对表达量。用样品 1 的标准化信号/样品 2 的标准化信号可以得到一个比值,以倍数或百分比表示。相对定量 RT-PCR 的实例见图 13-4。
操作方法所属实验:相对 RT-PCR: 样品定量实验
竞争性 RT-PCR: 拷贝数的评估
加热 10min,变性二级结构,然后立即放在冰上。7. 加 2ul 的 10XRT-PCR 缓冲液。8. 加 1ul 的 20U/ulSUPERaseIN。9. 加 1ul 的 100~200U/ulMMLV 逆转录酶。10.42°C 孵育 lh。11.95°C 加热 10min 使逆转录踌失活。12. 继续进行扩增反应,或-20°C 储存。第二部分:PCR 扩增这一方案中 PCR 扩增的宗旨与相对 RT-PCR 中描绘的相同(见方案 1)。方案设计包括6 个反应及额外的 10% 份额。这对于一个
操作方法所属实验:竞争性 RT-PCR: 拷贝数的评估
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RT-PCR 原理与实验技术

性由两个人工合成的引物序列决定。反应分三步: A.变性:通过加热使 DNA 双螺旋的氢键断裂,形成单链 DNA; B.退火:将反应混合液冷却至某一温度,使引物与模板结合。 C.延伸:在 DNA 聚合酶和 dNTPs 及 Mg2+存在下,退火引物沿 5‘ —— 3’ 方向延伸。 以上三步为一个循环,如此反复。 3. 逆转录酶和 RT-PCR 逆转录酶(reverse transcriptase)是存在于 RNA 病毒体内的依赖 RNA 的 DNA 聚合酶,至少具有以下三种活性: (1)依赖 RNA

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RT-PCR步骤

一、总RNA提取1. 取200mg组织,放到1.5mlEP管中,加入1mlTrizol剪碎。2. 震荡30s。3. 加0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min。4. 12000×g,4℃离心,15min。5. 吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。6. 加等体积异丙醇,-20℃,30min。7. 12000×g,4℃离心,10min。在管底部可见微量RNA沉淀8. 弃上清,加75%乙醇1ml,振荡。9. 7500×g,4℃离心,10min。10. 弃上清,用滤纸小心吸取残留液体

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相对 RT-PCR: 引物与竞争子比例的决定实验
这个方案的目的是要选择一个 18SrRNA 引物和竞争子之间的恰当比例,可以模仿目的转录本的表达量。对于大多数转录本来说,一般比例为 3:7。对于模板比较稀少的,采用2:8 或 1:9 可能更恰当。准备的 PCR 反应混合物应比 5 个反应多 10%。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
实验概况收录 1 操作方法 · 3 相关文章
逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR,rtpcr)
逆转录-聚合酶链反应可应用于:(1)分析基因的转录产物;(2)获取目的基因;(3)合成cDNA探针;(4)构建RNA高效转录系统。
实验概况收录 4 操作方法 · 26 相关问答 · 3 相关文章
应用mRNA反转录扩增cDNA(RT-PCR
酶促催化使RNA反 转 录 为cDNA第一链。 一 条寡聚脱氧核苷酸引物先 与 mRNA杂交,然 后 由RNA依赖的DNA聚合酶催化合成相应互补的cDNA拷贝,后者能进一步 用 于PCR扩增。依据实验的不同目的,针对单链cDNA第一链合成的引物 可根据特殊的靶基因设计特殊的引物与之杂交,或可用随机引物与所有mRNA杂交等。
操作方法所属实验:应用mRNA反转录扩增cDNA(RT-PCR)
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