我们在设计pcr引物的时候,经常需要将设计好的正反向引物与基因组DNA序列进行比对验证,但是因为反向引物是反向互补的,所以有些麻烦。因此,在这里介绍两个非常的小工具,一个是在线的模拟PCR,一个是本地运行的程序包,我会以附件形式上传,不需要丁当即可下载。两个都写得非常详细,相信大家都能看懂。不知道这个帖子能不能加分?希望版主看到后给予加分奖励 方法一:UCSC中的In-Silico PCR 1、登录UCSC,网址链接http://www.genome.ucsc.edu/index.html
liuwenbinahslyy 基因芯片数据分析时,比值大于2.0或者小于0.5被认为是有表达差异,为什么要相差两倍呢?这个比值与PCR或Western blot验证时的基因或蛋白表达差异是否是一致的(即是否也是相差两倍以上)?按理说PCR或Western blot检测表达差异根本不需要相差两倍以上,这还取决于重复实验的次数及数据的分布情况。 zjubell liuwenbinahslyy wrote
相关专题 验证引物我们做实验,有时会用到别人已经用过的引物,但如何才能知道这个引物是否正确呢?我通常利用prime 5.0来验证引物。下面我用常用的内参GAPDH将验证过程介绍如下:GAPDH的引物序列来自一片外文文献:上游:AATGCATCCTGCACCACCAA下游:GTAGCCATATTCATTGTCATA所得片断为516bps。首先在pubmedline中查到GAPDH的mRNA序列,如图然后打开primer 5.0,点file→new→DNA sequence,将上面
菌种活化:干粉标准菌株 标准贮备菌株 工作菌株; 1.1 金黄色葡萄球菌、大肠埃希氏菌、铜绿假单胞菌、枯草芽孢杆菌标准菌株: 挑取部分干粉溶解于0.9% 无菌氯化钠溶液中,划线接种于营养琼脂平板上,36℃±1℃ 培养18-24 小时。并观察菌落形态。 a. 金黄色葡萄球菌:菌落凸起,圆形,不透明; b. 大肠埃希氏菌:菌落稍凸,圆形,湿润,乳白色; c. 铜绿假单胞菌:菌落扁平,圆形,边缘不整齐,光滑湿润,可产生蓝绿或黄绿色素; d. 枯草芽孢杆菌: 表面粗糙不透明