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trizol法同时提取rna、dna、蛋白质
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条结果
综合
实验
方法
问答
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问
chip
实验问题
Eason老歌迷
看了他的图，觉得是基因组DNA降解了或者根本没有提取出来。因为都没有看到DNA样品，亮带大小都在1200bp一下显然不是基因组DNA。
1 回答
625 围观
问
CHIP
超声摸条件
蓝莓小布丁
您超声摸条件的预实验没问题，方法三加Nrasea可以一试。
2 回答
1622 围观
问
Chip
提纯DNA问题
loveliufudan
可能是由于以下原因导致的：1.提取过程中有污染：提取过程中有蛋白质，碱性磷酸核苷酸（RNA）或其他有机物污染，可能导致高 A260/A280 和低 A260/A230。2.DNA损伤：DNA 在提取过程中受到损伤，可能导致高 A260/A280 和低 A260/A230。3.提取过程中有错误：如果提取过程中有错误，例如试剂稀释的不当，可能导致高 A260/A280 和低 A260/A230。下面是一些补救措施：1.重新提取 DNA：重新提取 DNA，确保提取过程中没有污染或其他错误。2.消毒
2 回答
1386 围观
问
ChIP
-seq和
ChIP
-
ChIP
相比有哪些优势？
府宅
ChIP
-seq在样品数量方面比
ChIP
芯片更具优势，因为
ChIP
-seq需要更少的量。
ChIP
-seq产生更精确的蛋白质结合位点列表和转录因子，增强子和序列基序的鉴定。可以使用
ChIP
-seq分析染色质和组蛋白变体的核小体定位和翻译后修饰。这种分析尤其受益于增强的空间分辨率。
3 回答
1134 围观
问
ChIP
-nexus和
ChIP
-exo和普通的
ChIP
有什么不一样？
bamboopiggy
CHIP
-nexus 是能够在基因组中精确定位转录因子结合位点的新技术，该技术分辨率很高。
CHIP
-exo（
ChIP
外切酶），应用于各种蛋白因子结合在基因组上结合位置的鉴定，以达到碱基对水平的分辨率。c
3 回答
1363 围观
问
CHIP
超声条件求助
bamboopiggy
感觉你还要增加循环数，你smear的主带，感觉还在2000以上，打到500bp就可以了
2 回答
873 围观
问
ChIP
中input的问题
bob523740605
我最后做的是Qpcr ，数据分析的时候是一input为基准的分析，通过一个excel表分析http://http://d.dxy.cn/detail/4076728
2 回答
383 围观
问
为什么我的
ChIP
实验做出来，结果就是不理想呢？ 为得到理想的
ChIP
结果，怎么优化实验条件？
丁香实验
1、 染色质的制备：为了获得足量的染色质，我们的样品准备一定要充足。（IP实验的损耗较大，为保证实验用量，一次准备5×10E7个以上细胞较好）2、 优化交联固定条件：
ChIP
实验成功与否，直接取决于染色质完整性、抗原表位质量和抗体特异性（抗体一定买好的）。因此优化交联固定条件，富集丰度更高。3、 优化染色质片段化条件：要得到理想的
ChIP
结果，合适长度和浓度的染色质样品至关重要。（推荐的片段化程度为的染色质片段在150-900bp之间）。4、 免疫沉淀优化：在
ChIP
抗体富集优化实验中，使用
1 回答
636 围观
问
chip
-seq相关问题？
dxywode
你可以可以试试抗体可以多加点，加到4ug。阴性对照有条带是正常的，属于背景，关键是相对于目的抗体条带很弱才行。建议你做一个阳性
chip
实验证实你的体系没问题以及抗体没问题然后确定是否你的
chip
实验结果可信。希望能对你有帮助！
2 回答
417 围观
问
求
CHIP
实验的详细步骤？
府宅
磁珠组，用以质控IP实验流程是否合格。实验组加入目的蛋白对应的抗体，抗体应该选用IP级别的抗体，WB抗体不一定能满足IP实验，具体参见抗体说明。阳性对照一般选用已知的组蛋白抗体；阴性对照采用与目的蛋白抗体相同种属来源的血清；空磁珠组则不加任何抗体。(4) 下游验证（qPCR或
ChIP
-Seq）qPCR可以对目的片段进行定量分析。通过对目的序列的扩增，并与Input、阳性对照和阴性对照的量对比，就可以证明目的蛋白是否与预想的DNA序列发生了相互作用。
ChIP
-Seq 是将回收纯化的DNA进行建库
2 回答
597 围观
问
chip
实验
此用户已注销
图像质量有点差，看不特别清楚。 而且你这个是条带没出来。你有没有做input阳性对照啊。
3 回答
686 围观
问
组蛋白
ChIP
-Seq后，如何设计
ChIP
-qPCR引物验证某个基因测序结果？
Eason老歌迷
上ucsc网站，可以在搜索框中输入基因名，然后点击go,会出现它的位置，以及对应的富集区域。我们可以看到有富集峰，则可以选择这段的序列设计引物了。如果是有peak信息且富集的程度非常强的话可以设计当成阳性对照，阴性对照找没有peak富集的地方。
1 回答
632 围观
问
chip
-seq数据分析请教！！
土井挞克树
一般来说，通过
ChIP
-qPCR判断
ChIP
成功与否是通过比较目的蛋白在阳性区域和阴性区域的富集度差异来判断的。也就是说看峰值的富集度。
1 回答
525 围观
问
chip
-seq实验相关问题
txs900416
单克隆或多克隆抗体都可用于
ChIP
实验。 单克隆抗体只识别目的蛋白的单个表位，因此有非常高的特异性，和较低的非特异结合、较低的背景和杂带，而且生产批次稳定。但是单克隆抗体识别的表位可能位于蛋白与DNA结合位置或因联过程而被掩蔽，这种情况就导致抗体不能结合该表位导致实验失败，但这种情况通常极少出现。 多克隆抗体识别多个抗原表位，可以更有效地结合目的蛋白、成功率更高；但非特异结合也增加，导致杂带更多。多克隆抗体的生产批次不稳定。
1 回答
302 围观
问
chip
-seq实验相关问题
dxy_gwrp7ndq
ChIP
实验中的抗体对于特异性、亲和力、效价都具有较高要求，能够成功用于WB、IHC等实验的抗体并不确保能成功运用于
ChIP
，因此需要选用经过
ChIP
验证的商品化抗体，这类抗体常会标明
ChIP
grade。关于单抗和多抗。单抗具有特异性优势，但风险在于其识别表位可能恰好被掩蔽（DNA或交联环节），而多抗可识别多个表位可基本避免该风险。因此单多抗各有优缺点，应重点关注该抗体是否经过
ChIP
验证。
2 回答
234 围观
问
【求助】
ChIP
超声条件摸索
丁香实验
还有，一般超声片段范围在200_1000比较好，其实200_2000也是可以接受的，只要能保证70%以上在这个范围，就可以了！
2 回答
1542 围观
问
CHIP
超声后DNA浓度上不去，求助大神
xue454962321
按照CST9005试剂盒描述是抽提了细胞核，之后Micrococcal Nuclease酶切是在保证细胞核完整的状态下做的，离心之后需要的是沉淀（细胞核），这个时候上清里面是没有东西的，因为细胞核还没有被破膜；之后再把细胞核沉淀裂解，用超声的方法帮助破核膜，在离心取上清。此时，蛋白和核酸都应该在上清里面。如果你提取的是Micrococcal Nuclease酶切之后的上清，那应该就是没有DNA的；如果你提取的是超声之后的上清，那应该是要有DNA的。
2 回答
551 围观
问
chip
磁珠法
loveliufudan
在
CHIP
（Chromatin Immunoprecipitation）磁珠法后续进行SEA（Sequential Enrichment Analysis）时，可以尝试使用磁力架来实现磁珠的分离和洗涤步骤。磁力架是专门设计用于与磁珠结合并在磁场中进行分离的设备，能够方便快捷地收集和清除磁珠，减少操作时间和液体处理步骤。如果没有磁力架，理论上可以尝试使用磁铁来替代。然而，需要注意以下几点：1.磁力强度：磁铁的磁力强度可能相对较强，因此需要小心控制距离和接触时间，以避免磁珠过度吸附或损坏。2.清洗
3 回答
751 围观
问
可以通过什么方法检测抗体是否适用于
染色质免疫共沉淀
？
dxy_gwrp7ndq
目的蛋白抗体有效性也是染色质免疫沉淀实验的关键因素。要选择高质量,高亲和力和高效价的抗体来进行实验。先做Western Blot来检验在染色质免疫沉淀实验条件下抗体是否能够和目的蛋白的抗原决定簇结合而免疫沉淀。当抗体不能有效识别交联中的目的蛋白时，可更换其他不同靶向抗原决定簇的抗体或者降低甲醛固定交联时间。
1 回答
262 围观
问
不同处理方式的
ChIP
qPCR计算方法
凌晨三点Dxy
ChIP
-qPCR实验中常用的计算方法主要有以下两种：- **Percent Input法**：这种方法是通过将
ChIP
样本的qPCR结果与Input样本（即未经免疫沉淀处理的总DNA）进行比较来计算富集程度。具体操作是将
ChIP
样本的Ct值与Input DNA的Ct值进行标准化，以此来估算目标蛋白在特定基因位点上的富集情况。- **Fold Enrichment法**：也称为富集倍数法，这种方法是通过比较
ChIP
样本与一个参照样本（通常是IgG对照或其他非特异性抗体的
ChIP
样本）的qPCR
1 回答
1817 围观
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