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ChIP实验中的抗体对于特异性、亲和力、效价都具有较高要求,能够成功用于WB、IHC等实验的抗体并不确保能成功运用于ChIP,因此需要选用经过ChIP验证的商品化抗体,这类抗体常会标明ChIP grade。
关于单抗和多抗。单抗具有特异性优势,但风险在于其识别表位可能恰好被掩蔽(DNA或交联环节),而多抗可识别多个表位可基本避免该风险。因此单多抗各有优缺点,应重点关注该抗体是否经过ChIP验证。
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对照应使用igg而非igg的抗体,楼主应该是选错了对照的试剂。