chip-seq实验相关问题

单克隆或多克隆抗体都可用于ChIP实验。

单克隆抗体只识别目的蛋白的单个表位，因此有非常高的特异性，和较低的非特异结合、较低的背景和杂带，而且生产批次稳定。但是单克隆抗体识别的表位可能位于蛋白与DNA结合位置或因联过程而被掩蔽，这种情况就导致抗体不能结合该表位导致实验失败，但这种情况通常极少出现。

多克隆抗体识别多个抗原表位，可以更有效地结合目的蛋白、成功率更高；但非特异结合也增加，导致杂带更多。多克隆抗体的生产批次不稳定。