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组蛋白ChIP-Seq后,如何设计ChIP-qPCR引物验证某个基因测序结果?

相关实验:利用植物蛋白质芯片研究蛋白磷酸化实验

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DXY_6630

如题。现在已有组蛋白ChIP-Seq后的数据,找到几个目的基因,请问如何设计ChIP-qPCR引物验证某个基因测序结果?求大佬指点。

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1 个回答

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Eason老歌迷

有帮助

上ucsc网站,可以在搜索框中输入基因名,然后点击go,会出现它的位置,以及对应的富集区域。我们可以看到有富集峰,则可以选择这段的序列设计引物了。如果是有peak信息且富集的程度非常强的话可以设计当成阳性对照,阴性对照找没有peak富集的地方。

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