CHIP超声摸条件

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2023-01-16

准备做CHIP实验，正在摸超声破碎条件，用的设备是新芝（scientz）超声破碎仪，设置超声功率20%，超3s，停10s（即5次/min），超声结束后想看一看破碎后的DNA大小（准备打碎到500-800bp大小），用了三种方法跑琼脂糖胶得到的结果不太一样，其中方法一得到的条带感觉像RNA条带，所以方法三加RNaseA处理后再提。不知道该信那种，特请教园子里CHIP高手帮忙看下，谢谢。

2 个回答

蓝莓小布丁

2023-01-19

有帮助

您超声摸条件的预实验没问题，方法三加Nrasea可以一试。

loveliufudan

2023-01-16

有帮助

在进行CHIP实验中，使用新芝超声破碎仪设置20%的超声功率，超3s，停10s（即5次/min）可能不够达到您想要的500-800bp大小。您可以尝试增加超声时间或加大超声功率。

对于破碎后的DNA大小的检测，琼脂糖胶电泳是一种常用的方法，但结果可能会因为提取和制备方法不同而有所差异。您可以尝试使用其他方法，如高效液相色谱（HPLC）或限制酶切割来确定DNA大小。

由于您提到方法一得到的条带感觉像RNA条带，所以使用方法三加RNaseA处理后再提取是一个不错的选择。