ChIP-nexus和ChIP-exo和普通的ChIP有什么不一样？

CHIP-nexus 是能够在基因组中精确定位转录因子结合位点的新技术，该技术分辨率很高。

CHIP-exo（ChIP外切酶），应用于各种蛋白因子结合在基因组上结合位置的鉴定，以达到碱基对水平的分辨率。

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ChIP-exo和ChIP-nexus方法得到的DNA片段长度都小于200bp，因此测序reads的接头含量要比普通的ChIP要高，它们去接头更是重要。

exo就是exonucleases，能够从5'至3'方向消化没有和蛋白结合的DNA。我的理解是，这样使得chip-exo捕获的片段更小，peak calling的精度更高，同时计算的motif也能更准确。