转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验
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简介
目前，用于转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验的方法主要有2种：凝胶迁移或电泳迁移率变动分析和染色质免疫沉淀技术。
原理
染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation, ChIP )的基本原理是特异性抗体沉淀拟研究的目标蛋白，富集在细胞内与此蛋白相结合的DNA片段并分析该片段序列。
为保持蛋白质-DNA复合物的稳定，在裂解细胞前，需要先用化学交联试剂将细胞内原有的蛋白质-DNA复合物固定。细胞裂解后，将高分子染色质随机切断为一定长度范围内的小片段，然后通过免疫学方法沉淀这些蛋白质-DNA复合体，再利用PCR技术特异性地富集目的蛋白所结合的DNA片段，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。
通过鉴定所获得的DNA片段，可确定该种蛋白在细胞内所结合的DNA序列；同时还可以对复合物中蛋白质分子的结构及化学修饰进行鉴定。图解示意如下17-3。
应用
转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验的常用应用领域如下：
转录调节蛋白与相应的 DNA 顺式作用元件的结合。
来源：丁香实验团队
操作方法
电泳迁移率变动分析，也称凝胶迁移率变动分析，该方法是用于检测 DNA结合蛋白、 RNA 结合蛋白，并可通过加入特异性的抗体来检测特定的蛋白质，并可进行未知蛋白的鉴定。
染色质免疫沉淀技术（转录调节蛋白与DNA的结合分析实验）染色质免疫沉淀技术，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的另一种常用技术。与前述的EMSA不同，ChIP技术可以真实地反映蛋白质分子在体内与基因组DNA结合的状况。
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