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CRISPR/Cas9 gRNA文库筛选功能基因

CRlSPR/Cas9是细菌和古生物菌用来抵抗外来质粒或噬菌体等遗传物质入侵的一种获得性免疫系统。利用CRlSPR/Cas9技术建立哺乳动物全基因组突变库或者与某类功能相关的基因突变体库,通过功能性筛选和富集以及随后的PCR扩增和深度测序分析,发掘与筛选表型相关的基因,称为CRlSPR/Cas9 gRNA文库筛选。gRNA文库是药物筛选或靶向筛选特定通路的理想工具,gRNA文库的建立将在功能基因筛选、疾病机制研 ...

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凉凉!最高 8 分一区,这 51 本期刊被曝列入国内高校「黑名单」,要投稿的注意了....

近日,网传华南理工大学医学院和中山大学附属第一医院发布了新的期刊「黑名单」,对出现在「黑名单」和「预警期刊名单」中出现的期刊,上述单位不鼓励投稿,且不给予相关经费支持。期刊黑名单如下:华南理工大学「黑名单」期刊及预警期刊名单中山大学附属第一医院不予经费支持与鼓励的期刊目录经笔者统计,本次「上榜」两校黑名单的期刊一共多达 51 本。四神刊地位依旧,8 分一区期刊竟不予支持细细端详这两份期刊「黑名单」,不难发现这些年响当当的毕业「四大 ...

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免疫分析中,遭遇HAMA等干扰问题如何破?

免疫分析中出现问题的一个常见原因是干扰性抗体,如众所周知的人抗鼠抗体(Human anti-mouse Antibodies,HAMA)、一般的抗动物抗体、嗜异性抗体(Id)或类风湿因子(rheumatoid factors,RF)。有趣的是,由于今天的治疗性单克隆抗体药物几乎完全是人源化的,所以真正的HAMA的流行率正在稳步下降。然而,随着近年来类风湿和过敏性疾病等发病率的上升,抗体引起的干扰在未来仍将具有高度的临床相关性, ...

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SLAM-seq给您的不仅仅是RNA-seq!

SLAM-seq—RNA合成及降解代谢动力学分析,基因动态表达研究的首选基因表达是一个动态的过程,取决于细胞内环境的稳态以及对环境的适应性,基因信息调控的转变可能会导致人类疾病的发生。这些基本生物学进程的背后是一个非常精密的分子调控事件,它们控制着RNA转录,加工和降解相关的动力学(图1)。了解基因调控的分子基础需要以转录特异性和系统的方式深入了解RNA合成和降解相关动力学。但是,对于常规的RNAseq,我们只 ...

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含多个磷酸化位点的多肽的合成

生命活动与蛋白质的动态变化密切相关, 很多情况下某些蛋白质是通过各种翻译后修饰来完成或改变其功能。在数量众多的蛋白质翻译后修饰中,蛋白质磷酸化修饰无疑是最重要的一类,它是指通过蛋白激酶(Protein kinase,PK)介导的酶促反应把磷酸基团从一个化合物转移到另一个化合物上的过程(Figure 1所示),是生物体内存在的一种普遍的调节方式。现今发现的所有人类蛋白质中超过30%可被磷酸化修饰,这一修饰在细胞信号的传递过 ...

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作为多肽使用者,您该了解的多肽纯度

纯度是一个相对概念,没有绝对的纯度,产品的纯度与其检测手段关系密切。而多肽的纯度通常是指利用反相高效液相色谱(RP-HPLC)检测出的纯度,即在一定波长的紫外光检测器下目标多肽峰面积占总峰面积的百分含量,其数值与仪器状态以及实验条件密切相关,下面对几个主要参数进行介绍。 检测波长(Wavelength):多肽中的肽键即酰胺键,通常在220 nm处有较强吸收(与蛋白质类似),所以一般选用220 nm作为多肽的检测波长;某些多肽中 ...

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基因编辑已获奖,快看看什么方向适合你

基因编辑技术是一种通过使用靶序列特异性工程核酸酶来操纵真核基因组的新兴治疗手段,包括模型细胞系的开发、疾病机理的发现、疾病靶标的确定、转基因动植物的开发和转录调节。 由于基因编辑技术在促进基因组中序列的正确校正方面所具有的特殊优势,基于基因编辑的疗法正被积极地开发为治疗多种疾病的下一代治疗方法。到目前为止基因编辑系统历经 3 代,包括锌指核酸酶(ZFN)、转录激活因子样效应子核酸酶(TALEN)和 CRISPR/Cas9。 1. 锌指核 ...

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常用载体元件介绍及病毒载体应用

1.常用载体分类:2,常用载体元件介绍:(1) 启动子:启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性。启动子主要分为广谱启动子和特异性启动子。广谱启动子为在各种组织、细胞上广泛表达的启动子;特异性启动子为在特异性组织或者细胞类型上表达的启动子。常用广谱启动子有CAG,CMV,EF1a,PGK等,还包含启动RNA的III型启动子U6和H1启动子;常用特异性 ...

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科研汪们不讲武德,已经靠「耗子尾汁」发 Nature 了!

「刚才有个朋友问我,马老师,发生甚么事了?」 「我大意了,没有闪」 「年轻人不讲武德,来,骗,来偷袭,我 69 岁的老同志,这好吗?这不好」 「我劝这两位年轻人,耗子尾汁」如果要问这两周中文网络上最流行的语句是什么?答案必然是浑元形意太极拳掌门人马保国的经典语录。马保国老师「诙谐幽默」的发音,以及长久以来受到的戏谑。使其在健身房挨打后发布的视频快速引爆全网,创造了大量网络流行梗,其中最广为传播的,莫过于「耗子尾汁」。当全网玩「耗子尾汁」梗时,有细 ...

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基因敲除结核杆菌助力研究细胞焦亡的信号通路

2020 年 10 月 21 日,武汉大学章晓联、殷雷老师作为共同通讯作者在 Science Advances 在线发表研究成果 “Mycobacterial EST12 activates a RACK1–NLRP3–gasdermin D pyroptosis–IL-1β immune pathway”,该研究鉴定了一种从M. tbH37Rv 分泌的细胞焦亡诱导蛋白 EST12(Rv1579c)。导读:细胞焦亡是一种程序性细胞死亡的炎性形式,与消除病原体感染有关。该文章介绍了一种诱导巨 ...

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CRISPR 基因编辑利器:Nature 子刊整合 30 种 gRNA 设计工具,强推这 2 种!

2020 年 10 月,Emmanuelle Charpentier 与 Jennifer Doudna 因为在「魔剪」CRISPR 用于基因编辑的原创性工作获得了诺贝尔化学奖。此时,离她们关于「魔剪」最重磅论文的发表,才仅仅过去 8 年。虽然 CRISPR 因其方便好用著称,如此短的发展历史,意味着这项技术还有极大的提升空间。在 CRISPR-Cas9 系统中,Cas9 核酸内切酶需要与一段长度约为 100 核苷酸的 Guide RNA(gRNA)的形成复合物,并在 gRNA 与目标序列结合的引导 ...

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种草一款无细胞蛋白质表达试剂盒

先来看下传统重组蛋白表达系统:传统重组蛋白表达系统应对的挑战:操作流程长:5天-4周时间很多蛋白不能在细胞内成功表达不可以改造目标蛋白以大肠杆菌为代表的原核蛋白表达系统是常用的表达系统,具有表达量高和成本低的优点,但是蛋白质翻译后缺乏加工机制(比如形成二硫键和蛋白糖基化等),且很难保留生物活性。以甲醇毕赤酵母为代表的酵母蛋白表达系统,具有表达量高,可诱导,糖基化机制接近真核生物等优点,但是部分蛋白产品易降解,表 ...

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从冻存的全血样本中快速分离出基因组 DNA

【实验案例】动物基因组试剂盒提取全血基因组使用动物基因组提取试剂盒,从冻存的全血样本中快速分离出基因组DNA。【样品】冻存的全血样本【样品准备】将冻存的血液样品充分融化后混匀。【操作步骤】1.活化硅胶膜将吸附柱放入收集管中,加入250 ul Buffer BL,12,000 g离心1 min,活化硅胶膜。2.样品消化(1)取20 ul Proteinase K至1.5 ml离心管底部,然后加入200 ul充分混匀的全血样品,涡旋振荡10 s。(2)加入200 ul Buf ...

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有效性超90%的新冠疫苗,“低温”是关键

目前获得FDA紧急使用授权的mRNA核酸疫苗A,需要-70摄氏度的温度条件下保存; 这些超低温储存的疫苗在装有干冰的容器中从制造商那里运出,配送中转中心或疫苗接种点应在收到疫苗后24小时内重新包装干冰,并每5天重新包装一次,以保持所需的温度。如果疫苗放在2到8摄氏度的冰箱中保存,须在5天(120小时)内使用。

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性激素六项这么看,简单明了!

性激素六项检测,是内分泌激素系统检查。但这六项都包含什么?分别有什么意义?什么时候检查合适?大多数人都说不清楚,今天我们来详细介绍一下。性激素六项是女性的基础检查。检查基础性激素前至少一个月不能用性激素类药物,包括黄体酮、雌激素类,否则结果不可靠。当然,治疗后需要复查性激素的除外。检查性激素可以在月经的任何时间,每个时段的正常值不同。什么是基础性激素水平?但是诊治不孕症一定要先了解基础性激素水平,所以要选择月经周期 ...

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老师说「原红与早幼红」就像小李子 20 年变化那么大!为啥我看不出来?

晃晃悠悠,规培轮转到了细胞室,显微镜、骨髓片、认细胞,时隔多年,又一次落入细胞的魔掌之中,我认了——但就是,真的认不准。在细胞室我感受到了一种诸事不顺畅的感觉。1.显微镜镜下的方向和实际的方向是反的,对于我这样一个连左右都要思考那么片刻的马路杀手来说,要以一定的顺序来阅片,计数分类 200 个有核细胞,简直太难了。血涂片阅片顺序结果就是看着看着,就不记得这个片该怎么移动了,顺序乱了,脑子懵了,再来一次。除了方向的困难,还有双眼看 ...

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他在尸检时偷走患者大脑,切成 240 块私藏 43 年:史上最疯狂的医生

皮肤被剥离,头盖骨被锯开,十二对脑神经被逐一切断,随后是颈动静脉、椎动静脉……一颗大脑被小心翼翼地从颅腔中取出,第一次呈现在世人面前。这是一颗天才的大脑,在过去的 76 年里,无数天马行空的设想从这里产生又被证明:E = mc²、光电效应、量子力学、狭义和广义相对论……这是开创了现代物理学先河的大脑,这是被时代杂志视为「纯粹智力的化身」和「世纪人物」的天才的大脑。这是爱因斯坦的大脑。偷走爱因斯坦的大脑「它绝不能就这样被焚毁。」当托马斯・哈维 ...

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用光改变世界,光遗传学技术原理及光敏蛋白全介绍

光遗传学(optogenetics)是结合了光学(optics)及遗传学(genetics)的技术,借助其,我们能在活体动物甚至是自由运动的动物脑内、脊髓、外周神经内,精准地控制特定种类神经元的活动。光遗传学在时间上的精确度可达到毫秒级别,在空间上的精确度则能达到单个细胞级别。2010年,光遗传学被Nature Methods选为年度方法,同年被Science认为是近十年来的突破之一。这项技术目前在神经科学领域应用非 ...

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过氧化氢灭菌与传统灭菌对比详解

当前市场上的常规灭菌方法主要包括臭氧微醇灭菌,紫外线辐射灭菌,甲醛灭菌和当前出现的过氧化氢灭菌。上述杀菌方法在各种场合都有使用,但是传统的细菌方法在实际应用中存在致命的缺点。为了克服传统灭菌方法所带来的问题:灭菌效果差,对设备的腐蚀性高以及对人体的危害等,双氧水空间灭菌系列设备应运而生。过氧化氢,一种有效的消毒剂首先,过氧化氢(H2O2)是一种天然存在的化学物质,广泛存在于空气和水中。早在 18 世纪,人类就发现并开始使 ...

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化学遗传学技术原理及其应用

化学遗传学技术(或称药理遗传学技术)是近年来与光遗传学一起出现的重要新技术。该技术通过对一些生物大分子实行改造,使其能和先前无法识别的小分子进行相互作用,从而达到可控、可逆(可以随时加入或除去化合物,从而启动或中断特定的反应)控制生物大分子的活性,该技术已经在信号转导、药物开发、功能基因组学等方面的研究中得到了广泛的应用。他们被广泛用于以细胞特异性、无创地增强或抑制神经元的活动。虽然DREADD缺乏像光遗传学那 ...

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