The recent development of next-generation sequencing (NGS) technologies allowed various authors to imagine, test, and validate new approaches for TE analysis, in their nature, type, activity, or quantity. In this chapter, we describe briefly
染色质免疫沉淀(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)是用于检测细胞核天然染色质结构内的蛋白质与DNA之间相互作用的通用经典技术。近些年来NGS测序技术快速发展,基于NGS测序技术的ChIP-Seq测序分析为用户提供了蛋白质/DNA相互作用的高分辨率基因组范围视图,这是使用实时PCR分析无法实现的。ChIP-seq测序分析因此成为一种适合研究正常发育过程中或病理状态下发生的表观遗传变化的强大技术。 本次研讨会主要内容包括: 1.ChIP和ChIP seq的区别
高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的。目前高通量测序的主要平台代表有罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch GS FLX sequencer),Illumina公司的Solexa基因组分析仪(Illumina Genome Analyzer)和ABI的SOLiD测序仪(ABI SOLiD sequencer
, a pipeline that we have developed to detect Transposable Elements-associated structural variants (TEASVs) using Next Generation Sequencing (NGS) technologies.
相关专题 著名遗传学家George Church等人综述二代测序(NGS)实验中错误的来源,以及怎样利用重复去避免或减少这些错误发生。相关文章发表于2013年12月10日的《Nature Reviews genetic s》杂志上。 尽管测序 技术在不断发展,但不论是哪种测序平台,测序过程中都不可避免地存在一些错误。 2011年7月发表在《Nature Biotechnology》上的一篇文章就曾为研究人员以及杂志审稿人敲响了警钟。文章指出
基因编辑技术的飞速发展, 特别是近年来 CRISPR 技术的广泛应用,使得人类拥有了前所未有的改变和修饰基因组的能力。CRISPR 技术来源于细菌本身对抗噬菌体的「免疫系统」,这项技术利用单链引导 RNA (sgRNA) 和 Cas9 蛋白,可以在体内和体外简单、迅速、低成本实现基因编辑。利用 CRISPR 技术不仅可以对编码基因进行有效编辑和基因组的大规模筛选,而且还可以结合 NGS 对非编码 RNA(ncRNA)进行功能研究。CRISPR 技术已经广泛应用于全球各个实验室,几乎
至单个细胞或其他类型的微量样本如何提取核酸?想要了解微量核酸是否足够用于下游的PCR或NGS实验?想要寻找微量核酸放大方案,以便用于后续的多次以及多种研究手段?在本专题中都可以找到答案。