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凝胶迁移实验(EMSA
凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)可以:(1)研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用;(2)可用于DNA定性和定量分析;(3)用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。
实验概况收录 3 操作方法 · 2 相关问答 · 3 相关文章
转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验
目前,用于转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验的方法主要有2种:凝胶迁移或电泳迁移率变动分析和染色质免疫沉淀技术。
实验概况收录 2 操作方法 · 3 相关问答 · 3 相关文章
EMSA 时一直发现堵孔的情况,怎么解决?
1、改变胶浓度,一般 5-6%;2、提高探针浓度:10 nM - 0.5 μM 范围内改变试试;3、适当减少上样量;4、更换探针,上述 3 点都尝试了不行的话可能是探针上没有结合位点,所以蛋白不下去,此时可以看到探针下去了,而蛋白没有下去,这需要更换探针才能解决。
操作方法所属实验:凝胶迁移实验(EMSA)
EMSA 看不到迁移带是什么原因?如何解决?
1、蛋白降解或者蛋白在细胞系中表达低。对策:用蛋白跑一次 WB 可排除,若是这种情况,则需要更换样品或者加大样品量。2、探针上没有与蛋白结合的位点。对策:更换探针可解决。3、转膜效率低或者成像时间过短。对策:改善转膜条件,一般在 0.5X TBE 中恒压 60 V 转膜 1 h,最好放在冰上;成像时间也须从短时间逐渐延长,直至能看到成像。4、抗体级别不行。对策:更换 EMSA 级别的抗体可解决。5、电源出现故障同样也会导致迁移带无法形成,还有干扰电流通路的情况。对策:这些情况下需要检查电流是否
操作方法所属实验:凝胶迁移实验(EMSA)
EMSA
huarenqiang5
EMSA可以用包涵体获得的蛋白来做。
实验问答2 回答667 围观
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【求助】EMSA抗体的选择

luozhifeng339 请教各位达达,我准备做EMSA,如果做SUPER-SHIFT的话,该选择原装抗体还是分装的抗体呢,盼不吝赐教! wanglinling 看到一篇EMSA的文章,不知道里面有没有回答你的问题哈,不过英文的值得阅读哈。 GEL SUPER-SHIFT ASSAY/ EMSA Materials/Reagents: See Gel-shift assay Procedure

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凝胶迁移实验(EMSA)实验方法

凝胶迁移实验有称凝胶阻滞实验或电泳迁移率实验(EMSA,electrophoretic mobility shift assay),是一种用于蛋白与核算相互作用的技术。最初是用于转录因子与启动子相互作用的验证性实验,也可应用与蛋白-DNA、蛋白-RNA互作研究。一、实验原理EMSA主要基于蛋白-探针复合物在在凝胶电泳过程中迁移较慢的原理。根据实验设计特异性和非特异性探针,当核酸探针与样本蛋白混合孵育时,样本中可以与核酸探针结合的蛋白质与探针形成蛋白-探针复合物;这种复合物由于分子量大,在进行

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电泳迁移率变动分析
电泳迁移率变动分析的基本过程可分为如下几步:(一)核蛋白提取物的制备用于DNA结合分析的EMSA实验的蛋白质样品可以是纯化蛋白质、部分纯化蛋白质或核细胞抽提液。A.培养细胞至适当密度,用预冷的PBS洗涤细胞2次,吸干净余液。加适量PBS,将细胞刮下。B.4 °C、500 g离心5~8 rnin,小心吸掉上清。注意事项:离心机提前预冷。C. 加400 µl 细胞膜裂解液,涡旋混匀15 s,立即置于冰上15 min。D.加25 µl 10% NP-40,涡旋混匀15 s,立即置于冰上1 min。E
操作方法所属实验:转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验
凝胶迁移
存在-20℃。 二、 探针的纯化 通常为实验简便起见,可以不必纯化标记好的探针。在有些时候,纯化后的探针会改善EMSA的电泳结果。如需纯化,可以按照如 下步骤操作: 1.  对于100微升标记好的探针,加入1/4体积即25微升的5 M醋酸铵,再加入2体积即200微升的无水乙醇,混匀。 2.   在-70℃至-80℃沉淀1小时,或在-20℃沉淀过夜。 3.  在4℃,12 000 g-16 000 g离心30分钟。小心去除上清,切不可触及沉。 4.   在4℃,12 000 g-16 000 g离心1分钟
操作方法所属实验:凝胶迁移实验(EMSA)
土井挞克树
可能是堵孔,排除一下堵孔的问题。
实验问答1 回答439 围观
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电泳迁移实验(EMSA)方法

效率。 (5) 标记好的探针最好立即使用,最长使用时间一般不宜超过3天。标记好的探针可以保存在-20℃。 2. 探针的纯化: 通常为实验简便起见,可以不必纯化标记好的探针。在有些时候,纯化后的探针会改善EMSA的电泳结果。如需纯化,可以按照如 下步骤操作: (1) 对于100微升标记好的探针,加入1/4体积即25微升的5M醋酸铵,再加入2体积即200微升的无水乙醇,混匀。 (2) 在-70℃至-80℃沉淀1小时,或在-20℃沉淀过夜。

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非放射EMSA实验技术讨论

EMSA是一个比较复杂的试验技术,由于工作原因接触这个试验技术到现在也有三年多的时间了,做了大概也有几百次吧, 那倒理想的试验结果的同时也碰到了很多莫名的问题和结果,到现在为止还有没有解决的,找不到原因的一个问题,呵呵! 现和smalldonkey商量一下将我对这个实验技术的总结和一个心得写出来给大家分享,批评指正。EMSA实验技术作为一个经典的DNA/protein,RNA/protein的检测技术,不是很多简单的实验技术可以替代的! 比如曾经在我们这个论坛中有站友提到

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染色质免疫沉淀技术(转录调节蛋白与DNA的结合分析实验)
染色质免疫沉淀技术,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的另一种常用技术。与前述的EMSA不同,ChIP技术可以真实地反映蛋白质分子在体内与基因组DNA结合的状况。
操作方法所属实验:转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验
🔥 染色质免疫共沉淀实验(ChIP)
能够成功地进行 ChIP 实验,需要充分尝试可利用的抗体,以获得最佳效果。 (四)DNA 鉴定在免疫沉淀复合物中的 DNA 分离提取后,可以通过 PCR 来进行鉴定。无论是 EMSA 实验还是 ChIP 分析,都可以较好地用于分析特定转录因子与相应 DNA 元件的结合活性,既可以用于定性分析,也可以进行相对定量分析,获得转录因子活化程度的相关信息。现有的方法主要局限于已知蛋白质及其结合的 DNA 片段分析,进行 DNA 芯片或者二代测序鉴定。
操作方法所属实验:芯片技术
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电泳迁移实验(EMSA)方法

改善EMSA的电泳结果。如需纯化,可以按照如 下步骤操作:(1) 对于100微升标记好的探针,加入1/4体积即25微升的5M醋酸铵,再加入2体积即200微升的无水乙醇,混匀。(2) 在-70℃至-80℃沉淀1小时,或在-20℃沉淀过夜。(3) 在4℃,12, 000g-16, 000g离心30分钟。小心去除上清,切不可触及沉。(4) 在4℃,12, 000g-16, 000g离心1分钟。小心吸去残余液体。微晾干沉淀,但不宜过分干燥。(5) 加入100微升TE,完全溶解沉淀。标记好的探针最好立即使用

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EMSA

  Preparing of cell extracts       Cells (e.g. 293 cells) of one 6-well (10 cm2, app. 106 cells): add 100 µl/well : 1x EMSA lysis buffer (stock sol.: 5x ): Ø       Lysis of cells

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