EMSA求教！！！

emsa又叫凝胶迁移，它是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术，可用于定性和定量分析。

emsa注意事项:

1.DNA-复合物或RNA-复合物比非结合的探针移动得慢。

2.同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同，可是双链或者是单链。

3.检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白，可用纯化蛋白，部分纯化蛋白，或核细胞抽提液。

4.在检测RNA结合蛋白时，依据目的RNA结合蛋白的位置，可用纯化或部分纯化的蛋白，也可用核或胞质细胞抽提液。

EMSA实验需要设置许多组对照实验。

EMSA非放射性探针设计要注意:

（1）防止错位配对、封闭成环，排除目标序列以外结合位点的

（2）防止产生空间位阻

（3）注意AT/GC比例

（4）EMSA探针不宜太长，一般是几十碱基对。太长会产生过多结合位点导致结果分析困难，还会产生超级螺旋结构而掩盖结合部位。

（5）建议采用Biotin或红外荧光标记，尽量不要采用DIG标记。，探针两端都有标记以提高灵敏度