梦里共筑三千尺
每份报告会包含肿瘤名,标本类型,突变的基因位点,可能有疗效的药物,我想问最后整理出来的报告是什么形式,ppt还是文档形式,需要用到哪些绘图软件和数据分析软件呢,我的初步想法是先用个表格,把基本信息都列出来,找一些病例间的共同点和不同点,然后看一些分析的文章,看看别人分析的思路,有没有合适的文献推荐呢,一般几十例病人整理出报告需要多长时间呢
feixue7758527w
这个不能是没有目的的整理分析,最好有你想要的东西的情况,要针对性进行整理分析。如果只是单纯的整理,只需要把不同的条目进行归纳总结,简单一句话就是归类统计就好了。最好还是根据你想要的基因进行分析的。
土井挞克树
可以做个excel表格,把重要信息列出来
loveliufudan
您需要整理出的报告可以包括以下内容:
患者基本信息:包括姓名、性别、年龄、临床表现、病理诊断等。
检测结果:包括突变的基因位点、基因突变类型、突变频率、突变的影响等信息。可以考虑用表格的形式呈现。
可能有疗效的药物:根据基因突变的信息,列出可能有疗效的药物及相关文献。
分析和讨论:根据病人的基因检测结果,可以结合文献进行分析和讨论。比如,根据基因突变信息预测病人的治疗反应、预后等。
关于报告的形式,可以根据实际需要选择PPT或文档形式,并且需要考虑到报告的受众群体,例如专业人士或患者。
在制作报告过程中,可以使用表格、图表等工具,以清晰、简洁的方式展示信息。比如,使用Excel制作表格,使用R语言、Python等数据分析软件进行数据分析和绘图。
关于研究时间,需要根据病人样本数量和研究的深度而定。对于几十例病人的研究,整理出报告的时间可能在数天到数周之间。
huarenqiang5
整理出来的报告形式一般是PPT。需要用的软件很多,比如:
1. 质控:fastp
2. 比对:bwa
3. 变异检测:gatk
4. 文件处理:bamtools、badtools、sambamba、picard、vcftools等。