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CRISPR敲除导致基因组非目的基因丢失怎么办?

相关实验:全基因组CRISPR-Cas9基因敲除和转录激活筛选实验

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Lee1D7B

我利用crispr对野生型基因组中的多个基因进行敲除,最后将获得的突变株进行了一次基因组测序,与野生型菌株基因组对比发现有很多的非目的基因丢失了。这种情况怎么解决?

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2 个回答

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Eason老歌迷

有帮助

我建议你如果有很多基因丢失,你必须要再做一次了。crispr方法会产生丢失现象,具体参看这篇文章,Paul Q. Thomas 等人在 Nature 发表的一篇题为:Large deletions induced by Cas9 cleavage 论文显示,CRISPR/Cas9切割后小鼠受精卵中出现频繁的大量碱基缺失(千碱基量级)

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bamboopiggy

有帮助

重新做,没有别的办法,最好是一个基因一个基因的敲,否则你可能无法解释实验结果。

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