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手把手教你设计 siRNA

自 1998 年 Fire 和 Mello 首次提出 RNAi(RNA interference,RNA 干扰) 概念以来,越来越多的人开始重视小 RNA 的研究,之后 RNAi 在基因功能的研究中也得到广泛应用。RNAi 是一种存在于真核生物中的转录后基因沉默现象,在生物进化过程中能够抵御病毒感染及防止基因组中由于逆转座子元件扩增引起的不稳定。在 miRNA(microRNA)、siRNA(small interfering RNA) 等小 RNA 的介导下,RNAi 能够特异性地调控 mRNA 基因在 ...

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8.16 衰老可以逆转?Nature最新发现逆转脑干细胞的衰老过程!

① 衰老可以逆转?Nature 最新发现逆转脑干细胞的衰老过程!一项新研究指出随着年龄的增长,大脑会越来越僵化,导致脑干细胞功能出现障碍。Wellcome-MRC 剑桥干细胞研究所(剑桥大学)的多学科研究团队为此深入研究了年轻和衰老的大鼠大脑,希望能了解年龄相关的脑硬化对少突胶质细胞祖细胞(OPCs)功能的影响。为了确定老年 OPCs 的功能丧失是否可逆,研究人员将老年大鼠的 OPCs 移植到年轻大鼠的海绵状大脑中。结果发现老年脑细胞恢复 ...

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8.15 PRD:这么神奇!适度刺激耳朵就能有效改善帕金森患者的疾病症状!

① PRD:这么神奇!适度刺激耳朵就能有效改善帕金森患者的疾病症状!近日,一项刊登在国际杂志 Parkinsonism & Related Disorders 上的研究报告中,来自肯特大学的科学家们通过研究发现,对耳道进行温和控制性地刺激或有望帮助减轻帕金森疾病的症状。这项研究中,研究人员进行随机对照试验发现,连续两个月每天对耳道进行两次刺激就能够显著降低帕金森疾病的运动和非运动功能。参与者报告了他们机体的运动和灵活性得到了明显改 ...

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你是不是还没有收藏这些代谢通路数据库?

1. KEGGhttp://www.kegg.jp/ 偏重于代谢通路和整合代谢、基因和蛋白通路信息。特点是收录全,包括基因、蛋白和代谢产物等信息,缺点是缺少这些代谢产物在生物体内的浓度、功能和疾病相关信息。包含来自多种生物体( 4,700)的代谢途径(495个参考途径)的最完整和广泛使用的数据库之一。目前,KEGG拥有17,000种化合物(来自动物,植物和细菌),10,000种药物(包括不同的盐形式和药物载体)和近11,000种聚糖结构。 2. H ...

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慢病毒实验经典问题,你知道几个?

马上要做慢病毒实验了,完全无从下手啊!怎么准备实验,哪个公司的慢病毒产品靠谱啊?就算找到靠谱的供应商,我也不会找感染条件啊?就算找到感染条件细胞也不一定活啊?就算细胞活了咱也不会看荧光啊?就算咱会看荧光咱也不会设计引物验证啊?就算咱会验证咱也不知道啥时候可以做下游啊?…………慢病毒相关实验可能遇到的问题千百个,但是有些问题是大部分人都会遇到的,我们会把慢病毒实验经常遇到的问题以问答的形式教大家怎么做,本期我们先讲 ...

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在北极地区发现了未被证实的海洋卵菌纲生物多样性

卵菌纲是一种类似真菌的生物,是鱼类、农作物和藻类中臭名昭著的寄生虫。发表在《IMA真菌杂志》上的一项新研究分析了整个北极的样本,发现了由完全未知的生命分支组成的卵菌纲序列。随着北极持续变暖,卵菌群可能会迁移到北冰洋,寄生于非共同进化的宿主,导致无法估量的后果。我们感兴趣的是了解微生物的相关性,特别是在北冰洋。我们知道微生物是所有海洋食物网的基础,占海洋生物量的90%以上。微生物被浮游动物吃掉,浮游动物被鱼类吃掉,鲸 ...

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多语言如何改变多感官感知

我们知道不同的人可以分裂地感知蓝色/金色连衣裙等声音和图像,这取决于他们的大脑如何处理它们。 但双语制如何改变光和声音信息传递到大脑的方式?首先,金色/蓝色连衣裙“融化了互联网。”然后,Yanny / Laurel“分裂了美国。”这些幻想点燃了兴趣和争议,因为它们违反了我们的观念是直接的,未经过滤的外部环境版本的直觉。 毕竟,颜色不应该是意见问题。 当有人坚持认为我们看到的金色衣服是蓝色的,或者我们清楚听到的“Yanny”听起来像“Lau ...

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为啥你的细胞这么矫情?不愿贴壁呢?

我们可能都有过这样的经历:辛苦呵护的细胞,怎么也不愿意贴壁;贴壁了又很容易成块或者成团掉下来;原本贴壁的细胞,复苏后细胞不贴壁了;........遇到这样的问题你都如何解决?这次我们就来聊聊,为啥你的细胞为这么矫情,不愿贴壁呢?体外培养细胞贴壁与什么有关?首先并不是所有的细胞在体外培养的情况下都会贴壁,但大部分来自实体组织器官的细胞都会贴壁。贴壁的过程可能是这样的:细胞首先分泌细胞外基质,这种细胞外基质黏附在支持物的表面 ...

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m6A研究又有新手段了?赶紧来了解一下吧!

RNA 甲基化 m6A 是如今的研究热点之一,目前主要的研究思路包括差异表达的 write,reader 和 eraser 基因分析;m6A 抗体检测全转录组甲基化水平;分析 m6A甲基化水平变化的靶基因和下游机制研究。而在 7 月 25 日的 Cell 上新发表了一篇介绍不使用 m6A 抗体的检测 mRNA m6A 水平的 Resource 文章,小编第一时间和大家分享一下。作者开发这一方法的前提是有研究报道了 MazF 能特异性的识别无修饰的 ACA 序列并发挥 RNA 酶活性在 ACA 之前剪切底物。但 ACA 序列的第一个 A 发生 ...

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8.14 Nature子刊中科院利用单碱基编辑器首次在猪上实现多位点单碱基编辑

① 中科院学者Nature子刊利用单碱基编辑器首次在猪上实现多位点单碱基编辑单碱基编器是近年才出现的新基因编辑系统,被认为是基因编辑技术3.0版本。单碱基编辑器出现以后,很快被广泛地运用于动物、植物和人细胞的基因编辑。但是,以往的研究主要集中在单位点的碱基突变。而人类遗传性疾病以及动物遗传性状改变往往涉及到多个位点的单碱基突变,因此,对基因组的多个位点进行单碱基编辑才更有可能培育出能够模拟人遗传性疾病的大动物模 ...

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8.13 Lancet 子刊:警惕!体内多余的脂肪或会诱发心血管疾病和 2 型糖尿病发生!

① Lancet 子刊:警惕!体内多余的脂肪或会诱发心血管疾病和 2 型糖尿病发生!体内脂肪的积累通常发生于重要器官周围,其也被认为是内脏或腹腔内脂肪,这些脂肪的积累会增加肝脏、心脏、胰腺及骨骼肌中脂肪的储存,过量的内脏和异位脂肪反而会影响机体的代谢,从而诱发心血管疾病和 2 型糖尿病,测定这些脂肪的含量或能改善上述两种疾病的预测、疗法和预防策略。日前,一项刊登在国际杂志 The Lancet Diabetes & Endocrinology 上的研究报告中 ...

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8 年细胞培养大神的经验指南!

我养细胞有 8 年历史了,现在我的细胞已成为大家参观和崇拜、学习的对象。好的经验要分享,这就将我这几年来养细胞的经历和感想跟大家交流一下。启蒙老师的重要性一般进实验室都有师兄师姐带着做,他们就是你做细胞的启蒙老师。他们的操作手法、细节、理论讲解就成了你操作的准则,如营养液、细胞瓶的摆放位置;灭菌处理程序;开盖手法;细胞吹打手法等等。要学会他们的正确操作,在第一次的时候就要重视。好细胞要及时保种细胞要分批传代,这样即使有一批 ...

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这可能是史上最全面的 MTT 大汇总了吧!

实验前应明确的问题1. 选择适当的细胞接种浓度。一般情况下,96 孔培养板的一内贴壁细胞长满时约有 105 个细胞。但由于不同细胞贴壁后面积差异很大,因此,在进行 MTT 试验前,要进行预实验检测其贴壁率、倍增时间以及不同接种细胞数条件下的生长曲线,确定试验中每孔的接种细胞数和培养时间,以保证培养终止致细胞过满。这样,才能保证 MTT 结晶形成酌量与细胞数呈的线性关系。否则细胞数太多敏感性降低,太少观察不到差异。2. 药物浓度的设定。一定要多看文献, ...

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8.12 中科院,复旦大学揭示RNA甲基化调控母源mRNA稳定性机制

① 中科院,复旦大学 Molecular Cell 揭示 RNA 甲基化调控母源 mRNA 稳定性机制斑马鱼母源-合子转换 (maternal-to-zygotic transition, MZT) 过程伴随着母源 RNA 和蛋白质的降解以及合子基因组的激活 (maternal-to-zygotic transition, ZGA)。已有研究表明多种关键因素通过母源和合子途径促进母源 mRNA 降解,其中包括合子转录的 microRNA miR- 430,次优密码子的使用,N6 -甲基腺苷(m6A),尿苷 ...

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写paper之前,你需要做好这两件事

大家有没有想过,我们应该在什么时候开始写 paper?可能几乎所有人都会回答:「当然是做完实验,收集足够 data 了,才开始写 paper 呀。」很多研究生甚至从没想过这个问题,因为他们的任务就只是「做实验收集 data」,所以他的回答可能是 「导师让我写 paper 的时候,或者我要毕业的时候,就是应该写 paper 的时候。」其实……论文写作的开始实际上远远发生在你实际写 manuscript 之前。这句话怎么理解呢?Paper 并不仅是用于「记录」一个已完结的研究, ...

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Cell 主编告诉你,文章被拒的四大原因!

投文章是一件「被拒才是常态」的事情。对于 Cell, Nature,和 Science 这样的 Journal,每收到 100 篇 manuscript,其中只有 3 篇能通过 Editor 这关,进入接下来的 peer review 的阶段。就算是筛选条件稍微宽松一点的(high-impact)journal, 文章被接受的机率也很少超过 30%。换句话说,你花了好几年时间做实验收集 data,又花了一两年的时间写写改改,好不容易把 paper 投出去,结果是大于 70% 的概率被那些 high-impa ...

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四小招提高你综述写作能力!

或许有人认为,写文献综述其实就是找到一段话直接进行复制粘贴,其实并非如此,这样做虽然能增添字数,但查重率也会上去,而且这种生搬硬套的做法也会使文章读起来晦涩无味。那么应该如何撰写文献综述才会增添文章的魅力呢?大家可以借鉴以下四点:1、围绕研究主题思考需要进一步研究的内容。在研究一个问题时,要思考研究它的哪些方面,即将一个问题具体化为多个相关的问题,这样可以使研究更全面,也有助于抓住问题的主要矛盾,从而做有针对性 ...

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掌握了这些细节,师姐再也不用担心我养不好细胞啦~

很多小伙伴在养细胞的时候,总是会出现这样或那样的问题,很多时候,那是因为你没有注意以下的细节问题,现在我们一起来看看:细胞培养前的准备在您带上手套开始细胞培养之前, 先检查一下移液管和瓶子的数量是否充足, 以免在开始实验后再次出入操作台,这样可以降低细胞污染的风险。细胞培养基也应先预热, 选择只预热部分培养基而非整瓶加热, 不但可以节约实验时间, 而且可以避免因反复加热培养基而造成的蛋白质降解。结束操作后, 别忘了培养基对光敏感, 应尽可 ...

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科研菜鸟的实用选题方法 — 如何从文献中选题

选题是科研工作的第一步,也是同学们完成毕业论文的第一步。好的选题往往是成功的一半,那么我们应该如何选题?去哪找选题灵感呢?小编认为,医学选题灵感来源主要有两个:文献和临床。从文献中选题相信大家从刚刚接触科研开始,就在导师的要求下大量阅读文献,精读好文章,这对新手而言,确实有些费劲。但是只要坚持下来,量变就会发展为质变,一开始是「看的时候啥都懂,合上就忘了讲啥」,时间长了就会「一点之见即成文」。读了那么多文献,如何让文献 ...

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《Nature》最受关注的五篇论文(8 月)

英国著名杂志《Nature》周刊是世界上最早的国际性科技期刊,自从 1869 年创刊以来,始终如一地报道和评论全球科技领域里最重要的突破。其办刊宗旨是「将科学发现的重要结果介绍给公众,让公众尽早知道全世界自然知识的每一分支中取得的所有进展」。近期《Nature》下载论文最多的十篇文章(2019 年 7 月 9 日 ~ 2019 年 8 月 8 日):Potential roles of gut microbiome and metabolites in modulating ALS in miceWeizma ...

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