Metascape 是一个操作简单、功能强大的基因功能注释分析工具,能帮助用户将当前流行的生物信息学分析方法应用到批量基因和蛋白质的分析中,以实现对基因或蛋白功能的认知。与其他基因功能分析工具相比,Metascape 克服了常见的操作难上手、数据库缺乏更新造成的数据不准确,和结果不易理解的不足之处。所以不管对新手还是入门已久的同学来说,用 Metascape 做基因功能分析,绝对是不错的选择。一、Metascape 优点http://metascape.org/Metascape 集成了四
刚进实验室的小萌新,总有一种天下风云出我辈的风范,两耳不闻窗外事,一心只想发CNS。基因功能研究是当前生命科学和基础医学各领域的研究热点,也是每年高分文章层出不穷的领域。在基因功能研究中常用两种基础策略,功能减弱或缺失,功能增强或获得。 那么要如何研究一个基因的功能呢?实现基因Loss of function,CRISPR/Cas9基因敲除和RNAi干扰表达,哪种调控方式更好?移码突变和片段敲除哪个能更好的破坏目的蛋白的功能结构域?实现基因Gain of function,过表达和基因
基因研究中,敲除基因,研究该基因的功能是最常用的套路。一般 ShRNA 可通过 RNA 干扰来抑制基因的表达, 是基因研究中必不可少的环节。下面就主要围绕设计 ShRNA 引物序列,手把手教你构建 ShRNA 质粒,轻松敲基因。ShRNA 的设计原则1. 克隆到 ShRNA 表达载体中的 ShRNA 包括两个短反向重复序列,中间由一茎环序列分隔的,组成发夹结构,由 polⅢ 启动子控制。随后在连上 5~6 个 T 作为 RNA 聚合酶 Ⅲ 的转录终止子。2. 两个互补的寡核苷酸两端须带有
随着人类基因组计划的顺利进行,越来越多的新基因被发现,基因功能研究成为生命科学领域中的重大课题,目前基因功能研究方法主要有基因转导、反义技术、转基因和基因剔除、染色体转导、RNA 干涉等。一、 正常情况:DNA→mRNA→蛋白质→功能(遗传效应以及表型)二、 基因功能研究策略:1、基因功能的获得(gain-of-function)如:GFP转基因鼠1)、基因转移(transgenic):(1)、 指外源基因导入受体细胞后能随即整合到受体的染色体中,而相对稳定地表达,通过观察