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已知酶怎样查找相关基因?

相关实验:分子生物学实验

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dxy_rjmktzf5


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3 个回答

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loveliufudan

有帮助

如果您已经知道某个酶的名称或序列,可以使用以下几种方法来查找与该酶相关的基因:

基因数据库搜索:

可以使用各种基因数据库,如NCBI、Ensembl、UCSC Genome Browser等,来搜索与该酶相关的基因信息。在数据库中搜索时,可以输入该酶的名称或序列信息,以查找与之相关联的基因信息。

基因家族搜索:

如果已知该酶属于某一特定的基因家族,可以使用各种基因家族数据库,如Pfam、InterPro等,来查找该基因家族的成员基因信息。

基因共表达分析:

可以使用各种基因共表达分析工具,如GeneMANIA、COXPRESdb等,来查找与该酶在不同组织或细胞类型中共表达的基因信息。这些工具可以分析大规模基因表达数据,以确定与该酶相关联的基因集合。

文献搜索:

可以使用各种文献检索工具,如PubMed、Google Scholar等,来搜索与该酶相关的研究文章和文献。通过阅读相关研究,可以了解该酶与哪些基因有关联,并进一步查找相关基因信息。

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sswei

有帮助

查找一个酶的基因家族,可以使用NCBI工具。

首先,在NCBI网站上搜索该酶的英文全称,找到它的NCBI条目页面。

1.在该页面找到该酶的NCBI序列号,并将其复制。

2.进入NCBI的BLAST页面,选择Protein BLAST 选项,并将序列号黏贴到ENTER ACCESSION NUMBERS,OR FASTA SEQUENCES 框中。

3,在CHOOSE SEARCH SET 下拉菜单中选择NON-REDUNDANT PROTEIN SEQUENCESNR 选项,并点击BLAST按钮开始搜索。

搜索结果页面会列出与该酶相似的蛋白质序列,可能包含该酶不同基因家族成员。可以进一步筛选结果以查找特定的基因家族。

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

可以上ncbi网站上输入酶的分子式进行查找

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