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如何判断一个转录本对应哪一个基因

相关实验:转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验

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可乐少女4T7S

现在有一个新转录本,这个转录本的一部分与基因X的3’UTR部分重合,但是X要比这个转录本长很多,而且这个转录本是一个lncRNA转录本。

请问各位,这种情况这个转录本应该是一个新的lncRNA基因还是这个基因X的一个可变剪切形式呢?

我如何能判断是个转录本对应的是哪一个基因呢?有什么标准或者实验可以判断吗?

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2 个回答

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

大概率是可变剪切形式,可以使用已知的酶去裂解,然后检测裂解片段。

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loveliufudan

有帮助

这种情况可能是新的InCRNA基因也可能是基因X的一个可变剪切形式。

判断一个转录本对应哪一个基因可以使用多重杂交(qRT-PCR)或RNA-Seq技术对不同样本进行基因表达分析,比较不同样本中转录本的表达量。

另外还可以使用CRISPR-Cas9技术进行基因敲除,观察是否影响该转录本的表达。

最后还可以使用转录本特异性抗原技术对转录本进行鉴定,以确定其对应的基因。

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