如何判断一个转录本对应哪一个基因
可乐少女4T7S
现在有一个新转录本，这个转录本的一部分与基因X的3’UTR部分重合，但是X要比这个转录本长很多，而且这个转录本是一个lncRNA转录本。
请问各位，这种情况这个转录本应该是一个新的lncRNA基因还是这个基因X的一个可变剪切形式呢？
我如何能判断是个转录本对应的是哪一个基因呢？有什么标准或者实验可以判断吗？
2 个回答
土井挞克树
大概率是可变剪切形式，可以使用已知的酶去裂解，然后检测裂解片段。
loveliufudan
这种情况可能是新的InCRNA基因也可能是基因X的一个可变剪切形式。
判断一个转录本对应哪一个基因可以使用多重杂交（qRT-PCR）或RNA-Seq技术对不同样本进行基因表达分析，比较不同样本中转录本的表达量。
另外还可以使用CRISPR-Cas9技术进行基因敲除，观察是否影响该转录本的表达。
最后还可以使用转录本特异性抗原技术对转录本进行鉴定，以确定其对应的基因。
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