丁香实验_LOGO
登录
提问
我要登录
|免费注册

重叠延伸pcr连接不上

相关实验:分子生物学实验

user-title

dxy_dok45ep8

需要重叠延伸连接四个基因片段,分别是1072bp,2760bp,3423bp和1008bp,已经两两重叠p好了,经胶回收纯化后作为模板。这两个重叠好的片段之间的重叠区域为30bp,但是无法融合上。求大佬指点一下

wx-share
分享

3 个回答

user-title

bamboopiggy

有帮助

重新检查引物,尤其注意引物的方向,并且保证引物之间的温度差别不要太大,

user-title

毛利小五郎的徒弟

有帮助

有可能是引物的问题,检查引物后尝试

user-title

此用户已注销

有帮助

我也做过重叠延伸PCR,没出现过你这么多的问题。

pfu外切酶活性太高,缺dNTP的时候特别容易降解引物和融合的片段,所以容易在重叠的部位产生错误,要多加点dNTP,最后加pfu

第二轮重叠延伸的时候两个片段要加的少一点,延伸的时候容易错配,退火温度不能太低,延伸几个循环后再加两端引物。

发生在基因后端的23处突变,实在无法解释,不知道你片段多长,会不会在测序的后端是测序的问题,换个测序好的公司或从后端测试试。

提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
扫码领资料
反馈
TOP
打开小程序