深色样品的多肽得率测定？

在测多肽含量过程中，因为蛋白在碱性条件下颜色很深且调回pH7后颜色不会变浅，双缩脲法等比色法测多肽得率均误差很大，有没有什么办法可以准确测深色蛋白酶解液中的多肽含量？？

也尝试了紫外法（238nm）测肽键，不同酶解时间下的吸光值变化很小，几乎没有变化。