CO-IP实验怎么区别是两种蛋白直接结合还是有其他蛋白辅助相互作用？

Co-IP只能证明两种蛋白有相互作用，无法说明是直接还是简介的，如果想知道是直接还是间接的，可以做GST pull-down实验。

co-ip研究的是体内自然状态下的蛋白质互相作用，不能显示蛋白质之间的相互作用是直接还是间接的，不能排除是否有第三者（其他蛋白）在中间起桥梁作用，要区分可以跑胶看有几个条带！

可以双向做coip，用a蛋白去拉b蛋白，b蛋白去拉a蛋白，如果双向都能拉下来，说明他们之间有作用。如果想明确是不是还有其他蛋白，可以去做质谱。或者产物跑胶，考染，看是否还有别的条带