丁香实验_LOGO
登录
提问
我要登录
|免费注册

第二次pcr跑出来的条带和第一次pcr跑出来的位置不一样,这是什么原因?

相关实验:逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR,rtpcr)

user-title

dxy_us7co4pq

材料是植物叶片,想筛引物。提取rrna然后反转录,最后进行pcr。但是第一次pcr的时候条带大小大概是50bp左右,第二次p条带大概是250bp

wx-share
分享

4 个回答

user-title

灵枢天问

有帮助

可能是第一次的RNA有降解,逆转录出来的模板本身就有问题,所以p出来条带也有问题,太小了,你可以发个图片过来看看

user-title

bamboopiggy

有帮助

1.确定一下你两个引物之间的产物大小应该是多少,2,然后看一下pcr的扩增时间是否一致。

user-title

dxy_us7co4pquser-title

p出来的产物大概是250bp,我的2次循环数不一致,一次30个循环,一次34个循环,所以这就会导致2次p出来的结果不在同一位置嘛

user-title

土井挞克树

有帮助

首先你的确认你没有用错东西.
如果没有问题,二次PCR的话,那得看你的延伸时间和退火温度了.
2轮的退火温度最好调高些,以增强特异性.
延伸时间上,看你的产物大小.如果需要大条带,那延伸时间意义不大,最好能对一轮产物进行预期条带的回收后再做2轮,或者进行巢式PCR;要是需要小条带那就简单了,直接缩短延伸时间就好了.

user-title

juyue2010

有帮助

主要是看自己设计的引物扩增片段长度,第一次的可能是引物二聚体

提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
扫码领资料
反馈
TOP
打开小程序