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电泳条带总是跑不好?

生物学霸

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跑电泳的时候,也许很多人会羡慕别人的电泳条带清晰好看,自己的电泳条带有时候弥散,有时候歪歪扭扭。熟能生巧,只要你掌握正确操作步骤,你也可以跑得得心应手。

清洗玻璃板

蘸点洗洁精轻轻擦洗。两面都擦洗过后用自来水冲,再用蒸馏水冲洗干净后立在筐里晾干。若不继续使用,需用无水乙醇擦拭后晾干再妥善收起来,玻璃板之间垫玻璃纸隔开。梳子应用水洗干净,临用前用无水乙醇擦拭晾干。

灌胶与上样

1. 玻璃板对齐后放入夹中卡紧。然后垂直卡在架子上准备灌胶(操作前先往玻璃板间灌水,检查是否漏)。

2. 按配胶试剂盒说明书选择合适的分离胶浓度配置,最后加入 TEMED,之后摇匀即可灌胶。

配制凝胶时要充分混匀,此外应保证试剂的新鲜,特别是过硫酸铵。

灌胶时掌握好速度,避免气泡产生(注意浓度越小的胶含水越多,凝固后胶体积缩小越多)。

胶上加一层水,液封后的胶凝的更快。

灌胶时开始可快一些,胶面快到所需高度时要放慢速度。

操作时胶一定要沿玻璃板流下,这样胶中才不会有气泡。

加水液封时要很慢,否则胶会被冲变形。

未聚合的丙烯酰胺具有神经毒性,操作时应该戴手套防护。

梳子插入浓缩胶时,应确保没有气泡。

注意给积层胶留出足够的空间(《分子克隆》推荐长度为插入的梳齿长再加 1 cm)。

3. 当水和胶之间有一条折射线时,说明胶已凝了。再等几分钟觉得差不多的时候就可倒去胶上层水并用吸水纸将水吸干。

聚合时间由 AP 以及 TEMED 决定,通常在 30 min 左右,AP 不新鲜会导致聚合变慢,气温较低时胶是会凝得慢一些,必要时可适当增加 AP 以及 TEMED 的量,但通常不会超过 1 h。

若超过 1 h 甚至更长仍未聚合,应检查配制的操作有无错误。由于 TEMED 催化 APS 释放相关化学基团,再由 APS 释放的基团催化 Acr/Bis 聚合,所以如果 APS 不新鲜的话加再多的 TEMED 效果也不佳,这就是为什么推荐 APS 每周新鲜配置的原因。

4. 按说明书配积层胶,加入 TEMED 后立即摇匀即可灌胶。将剩余空间灌满浓缩胶然后将梳子插入浓缩胶中。灌胶时也要使胶沿玻璃板流下以免胶中有气泡产生。

插梳子时要使梳子保持水平。由于胶凝固时体积会收缩减小,从而使加样孔的上样体积减小,所以在浓缩胶凝固前最好在两边补胶至刚刚冒顶。待到浓缩胶凝固后,两手分别捏住梳子的两边竖直向上轻轻将其拔出。

5. 趁积层胶聚合的这段时间,取适当体积样本混合 1X SDS loading buffer(最好事前分装好,每次从冰箱里取一管即可),95~100°加热 5 min,若有沉淀可用稍低温度,比如 45~55°加热 1 h 达到变性的目的。我一般习惯分装 20 uL 到 PCR 管里,先和 loading buffer 混合好,临用前用 PCR 仪加热 95°C 5 min,效果不错。

6. 胶做好后连同玻璃板一起安装到电泳槽上,加入电泳缓冲液后开始准备上样(我们使用的 MV-III 型小型单垂直板电泳槽,电泳液至少要漫过内测的小玻璃板,电泳槽下面不用倒太多电泳液)。

加样前可用 5 ml 注射器或加样器先冲洗一下加样孔。用微量加样器贴壁吸取样品,将样品吸出不要吸进气泡。将加样器针头插至加样孔中缓慢加入样品(加样太快可使样品冲出加样孔,若有气泡也可能使样品溢出。加入下一个样品时,进样器需在外槽电泳缓冲液中洗涤 3 次,以免交叉污染。

目前我们做的 mini 胶上有 10 个上样孔,一般在第一个孔加入 marker,其余 9 个孔加入样品,也可在头尾孔内加入 marker,中间 8 个孔加样品。

加样前样品应先离心,尤其是长时间放置的样品。在未加样的孔中应加入等量的样品缓冲液。上样时,小心不要使样品溢出而污染相临加样孔。也可使用 10 uL 的枪头就行,比用微量加样器快很多,用枪头时注意不要插得太深,容易把玻璃板撑开,样品就落到胶和玻璃板之间的空隙了。

电泳

电泳槽内加入电泳缓冲液冲洗清除黏附在凝胶底部的气和未聚合的丙烯酰胺,网上有资料建议低电压短时间的预电泳,清除凝胶内的杂质,疏通凝胶孔径以保证电泳过程中电泳的畅通,但是在《分子克隆》上却反对这种做法,理由是会破坏缓冲系统 pH 的不连续性。

请各位按照实际经验来做即可。电泳时间和电压说法各异。按照各实验室的惯例或者电泳槽的使用说明来操作。电泳至溴酚兰刚跑出即可终止电泳,进行转膜。为减少蛋白质条带的扩散,上样后应尽快进行电泳,电泳结束后也应直接或者转印。

作者:dlzhangyu

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