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请问想做癌症的差异蛋白分析-生信分析,现在有了数据,但怎么作图,求助

相关实验:用 GST 融合蛋白检测蛋白质-蛋白质相互作用实验

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努力考博的王医生

请问想做癌症的差异蛋白分析-生信分析,现在有了数据,但怎么作图,求助

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2 个回答

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

1.进入网站首页http://www.cbioportal.org/,有很多不同肿瘤患者的数据集可以选择;也可以在红色方框内输入自己感兴趣的癌种,进行快速检索。

2.选定数据集。

点击Query By Gene,进入查找界面。

3.选择1处Co-expression,获取基因FN1的共表达基因。

4.筛选基因

5.将符合条件的基因单独复制到子表格中,进行绘图

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loveliufudan

有帮助

如果想要绘制生信分析结果的图形,一般可以考虑以下几种类型的图表:

热图(Heatmap):可以用于展示差异蛋白的表达量在不同组别间的变化情况,通常采用颜色编码方式,不同颜色代表不同的表达水平。

点图(Volcano plot):可以用于展示差异蛋白的表达量和显著性差异,在图表中将显著差异的蛋白点用红色或绿色标出。

柱形图(Bar plot):可以用于展示差异蛋白在不同组别间的表达量或者表达比例的变化情况,可以方便地进行组别间的比较。

散点图(Scatter plot):可以用于展示两个变量之间的相关性,例如可以将两组样本的蛋白质表达量进行比较,来探究差异蛋白的分布情况。

网络图(Network plot):可以用于展示不同蛋白质之间的相互作用关系,从而探究差异蛋白之间的生物学意义。


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