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想请问一下再设计靶点的时候怎么选择转录本啊?
我看了NCBI和ensemble两个数据库,里面收录的转录本有点不同。我在NCBI上找的最长的转录本在ensemble上找不到
loveliufudan
当设计CRISPR/Cas9基因敲除时,选择转录本是非常重要的。首先,需要考虑目标基因的功能,以确定要敲除哪个转录本。其次,需要考虑转录本的表达水平和分布,以确定是否能够有效地抑制目标基因的表达。
NCBI和Ensemble是两个不同的数据库,可能存在数据不同的情况。在选择转录本时,应该查询多个数据库以确定转录本的准确性,并对所有结果进行评估。如果发现在NCBI上找到的最长转录本在Ensemble上没有,可以询问其他数据库或者通过实验来验证该转录本是否存在。