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【求助】基因组dna文库和cdna文库的比较

lizzi 基因组dna文库和cdna文库在构建原理和用途上的主要区别是什么zhujoker cDNA文库以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体常用噬菌体或质粒载体连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。基因组含有的基因在特定的组织细胞中只有一部分表达,而且处在不同环境条件、不同分化时 ...

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【求助】Bradford

cdongni 我测蛋白质用的是Bradford法,实验室的酶标仪只有570nm 没有595,请问大家,用570测稳定吗?准确吗?我现在的R2只能到96!zhujoker 这个问题你只能问公司了?最好还是找一个595nm测吸光度的。但是做流失时像这种差距还是能做的,但是不知道是不是也适合测蛋白?dlzhangyu 可以的。以下是来自碧云天的说明书:使用说明:1. 完全溶解蛋白标准品,取10μl稀释至100μl,使终浓度为0.5mg/m ...

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【求助】mirna的抑制与过表达

liuying6477 想做mirna的抑制和过表达,请问1.过表达是否直接转ssc-let-7c MI0002445 stem-loopUGUGUGCAUCCGGGUUGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUUUAGAGUUACACCGUGGGAGUUAACUGUACAACCUUCUAGCUUUCCUUGGAGCACACU2.抑制表达是否是上个stem-loop序列的反义还是ssc-let-7c MIMAT000215 ...

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【求助】关于组织特异性启动子的结构的问题

galaxyzj 我有一个真核表达载体,包含一个Iba1启动子,来源于巨噬细胞的特异性基因Iba1,因此是个组织特异性的启动子,用来控制GFP的表达。启动子的结构见图1,其中加框部分是外显子序列。载体的结构见图2。载体的构建人说,这个载体的开放阅读框起始是Iba1基因自身的ATG,也就是图1里面Exon1内部加了下划红线ATG,GFP的起始密码ATG也是在一个读码框内。因此,这个载体最后表达GFP蛋白,并且N端融合 ...

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【求助】关于mirna侧翼序列的问题

redsky 我在mirbase查到hsa-mir-34a的序列如下:hsa-mir-34a MI0000268GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGUAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUGGGGCCC我在ensemble查hsa-mir-34a序列及其上游(5'端)10bp序列变成如下 ...

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【求助】AngII的问题

shuaibo2008 新手请教各位高手,我准备做AngII的相关实验,不知道如何分装保存,是买来的全都-20°C分装保存,还是先称取一部分分装,如果是称取部分的话,能用0.22um的滤器滤过吗?说明书很不详细啊。期待帮助哦,太感谢了zhujoker 你一部分分装也是分,还不如全分装。只要分装无菌完全可以不过滤的。侠骨仁医 如果不是在短期内使用的话,我建议你分装粉末,而不要溶解,因为溶解稀释后,浓度相对较低比较容易降解;如果万一 ...

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【求助】组成型的stat3的磷酸化是指先由基因先表达出stat3蛋白,再由细胞内的磷酸激酶使stat3磷酸化,还是细胞本身就能直接表达出磷酸化的stat3?谢谢

lsdcfhyj 组成型的stat3的磷酸化是指先由基因先表达出stat3蛋白,再由细胞内的磷酸激酶使stat3磷酸化,还是细胞本身就能直接表达出磷酸化的stat3?谢谢bigbang_0_0 是前者,是条件非依赖的,一表达,就被磷酸化。是不受诱导的磷酸化。且不被去磷酸化。lsdcfhyj 谢谢你的回答,你的意思是细胞中的磷酸酶也不能使其去磷酸化吗?bigbang_0_0 lsdcfhyj wrote:谢谢你的回答,你的意思是细胞中 ...

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【讨论】如何进行基因筛选?如何确立目的基因?

ybcz1974 本人刚刚涉及分子生物学领域,可能说得很不转业,请勿见笑!最近想做一种非整数倍染色体病的研究,有几个问题想请教大家:1、如果这种疾病是由于某一条染色体多一条引起,除了基因(DNA)数量上的改变,会不会出现基因组的差异,例如出现新的基因?或者基因突变?2、通过患者与对照血清基因筛选是否有意义?有没有可能发现基因表达差异?如何进行基因筛选?3、每条染色体都表达数百种基因,通过何种方法可以找到某条染色体特异性 ...

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【求助】关于序列标记

JaneyJuan 请教各位大侠:我现在手上有一个真菌的ITS序列,请问怎样标示其中的ITS1、5.8S rDNA、ITS2和18S rDNA区域?急~~~请高手帮忙!非常感谢~~freecell 你是不知道用什么软件在已知的ITS上去标示这些区域,还是不知道“ITS1、5.8S rDNA、ITS2和18S rDNA区域”在你手头ITS上的具体位置,想知道怎么样找到这些区域在ITS上的位置?JaneyJuan freecell wrote:你是不知 ...

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【求助】预测UTR序列

霍一刀hxs 各位高手,有没有专业的网站,可以根据一段cDNA序列,预测一下它的UTR区的序列?多谢。freecell http://171.66.122.45/content/15/5/742.fullor tryhttp://www.google.com/#hl=en&source=hp&q=+utr+prediction&aq=f&aqi=g-m1&aql=&oq=&gs_rfai=&fp=bcdf8cbbf06dc4f霍一刀hxs 谢谢freece ...

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【求助】BCL-2,Bax,caspase-3的检测方法?

luowen__ 各位前辈:小弟是刚开始做实验的研究生,老板要我检测组织中的BCL-2,Bax和caspase-3的表达。但是检测方法却没有具体说明。我想请教各位前辈有没有做过以上三种因子的检测,是用WB、RT-PCR检测,还是买专门的试剂盒检测,或者还有其他的方法?另外,什么方法检测比较便宜(我老板的经费不多)?小弟在这里先谢谢了!magichunter (1)经典的方法还是做WB,当然抗体比较费钱。(2)有专门测定caspa ...

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【求助】最普通的HEK293细胞能包装慢病毒吗?

summityoung 请问大家,用最普通的HEK293细胞能包装慢病毒码?谢谢freecell 从文献上看,已经有多篇文献报道了用HEK293来包装细胞。但是包装的效果可能没有其它293衍生细胞好。例如293FT来源于293细胞,293FT和293T细胞一样,都是转化了SV40大T抗原的293细胞的一个衍生物。这些细胞系具适宜的包膜和高表达反转录酶,能提高逆转录病毒的滴度。与293T细胞相比,293FT生长的更快, ...

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【求助】A基因被RNA干扰之后,B基因表达亦下调说明A和B关系如何?

s78293 求教各位老师:A基因被RNA干扰之后,B基因表达亦下调,说明A和B关系如何?或能提示其他什么?freecell 理论上说明B的mRNA水平直接受A调控。侠骨仁医 我个人觉得只能说明B基因可能和A基因有相关性,但是只通过简单的检测不能说明两者是直接关系还是间接关系,有可能是A基因直接作用于B基因,当然也可能A基因是通过C,D,E。。。等间接作用于B基因。lbqlxy 新手不理解二楼说的直接调控的意思是社么1 A蛋白直接 ...

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【求助】麻烦看下是野生型P53还是突变型P53

coco0663 P53NM_000546.4Transcript Variant: This variant (1) is a dominant transcript and encodes isoform a.麻烦高手看下,这是野生型P53还是突变型P53?Transcript Variant是否突变型的意思,那么NM_000546.4 所转录的是否就是突变型的P53?谢谢侠骨仁医 Transcript Variant的意思是变异体的意思,应该不是突变的意思,看了一下,人类 ...

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【讨论】人源BAX的mRNA序列有不同的类型?

longytu NCBI上面查到了BAX的mRNA的几种序列,有αβγ三种类型。。。。为什么BAX基因序列相同,且都是人源的,mRNA为什么序列不同呢??zjubell 大多数真核基因转录产生的mRNA前体是按一种方式剪接产生出一种mRNA,因而只产生一种蛋白质。但有些基因产生的mRNA前体可按不同的方式剪接,产生出两种或更多种mRNA,即可变剪接(alternative splicing)。人们发现,越是高等的动物,涉及mR ...

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【求助】观察细胞内的荧光蛋白,怎么样定量?

longytu 将两种荧光蛋白质粒导入细胞,观察FRET信号,怎么样给相互作用的两种蛋白定量?应该从哪个角度着手,荧光强弱,表达浓度?大家有没有更好的方法来活体细胞内定量蛋白质?版主freecell留言:自己提出解决问题的方法,然后请别人点评,这才叫“讨论”。你这个帖子纯粹就是求助,何故冠以“讨论”之名?freecell 质粒转染细胞后,可以通过流式或者WB,对蛋白进行粗略的相对定量。longytu 谢版主的回复。。。除了流式和WB ...

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【求助】关于MTDH的siRNA序列

lily1218 请问哪位做过关于MTDH的干涉,求助能发挥干涉作用的siRNA序列,十分感谢!freecell 自己在文献里面找,或者dharmacon或者ambion的库里面找。majian0064 5 CAGAAGAAGAAGAACCGGA 3 可以交流一下你的实验吗?我的邮箱majian10@mails.jlu.edu.cn本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙 ...

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【求助】急,关于突变的问题

xuchenmail 最近看了一篇文献,关于PIK3CA 基因突变的问题,文献说热突变位点在exon 9 (E542K,E545K) and exon 20 (H1047R),但是我根据pubmed上的数据,H1047R已经在21号外显子了,这是怎么回事啊?是文献错了吗?还是有其他的原因?zjubell 1.这篇文献是什么时候发表的?对序列更新也是很正常的事。另外,这篇文献IF是多少?2.是否存在可变剪接,他的突变株,是否是其他的剪接体的外显子中的?3 ...

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【求助】非编码序列突变与人类遗传病

xuyq706 近年逐渐发现非编码序列突变在人类遗传病中发挥重要作用,此类序列突变如何致病?对其致病性如何研究判定?freecell 这些都是医学遗传学上的内容。建议楼主留意一下教材和中文综述。shilei5794749 In the human genome , variations of non-coding seqences including 5’UTRs,3’UTRs,promoters,introns ,long-rang cis-control elemen ...

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【求助】β-actin在不同物种里的序列是一样的吗???

mnidr 我想做拟南芥基因和烟草基因的NORTHERN,想选择β-actin作为内参,请问,在拟南芥和烟草中β-actin的序列是一样的吗?如果在更远的物种里呢,比如动物????freecell 脊椎动物中不同物种的β-actin基因氨基酸之间的序列同源性超过98%。其它种属不清楚,你可以在NCBI里面blast一下。sherwing2009 可以在NCBI中,blast一下,相似性应该很高detector350 有一定相似度, ...

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