【求助】β-actin在不同物种里的序列是一样的吗???
丁香园论坛
4620
我想做拟南芥基因和烟草基因的NORTHERN,想选择β-actin作为内参,请问,在拟南芥和烟草中β-actin的序列是一样的吗?如果在更远的物种里呢,比如动物????
脊椎动物中不同物种的β-actin基因氨基酸之间的序列同源性超过98%。其它种属不清楚,你可以在NCBI里面blast一下。
可以在NCBI中,blast一下,相似性应该很高
有一定相似度,但是如果如果进行试验,通用性,要具体BLAST分析
基本是一样的
就像free版主说的,相似度很高,同源性应该可以达到98-99%,但是肯定不完全一样,这就是不同物种内参的引物不一样的原因,当然如果偷懒的话,也可以找到同源的序列,设计可以扩增不同物种的内参引物。
本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴
师兄微信号:shixiongcoming