琼脂糖凝胶电泳
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原理
琼脂糖是 D- 和 L- 半乳糖残基通过 α (1→3)和 β (1→4) 糖苷键交替构成的线状聚合物。L- 半乳糖残基在 3 和 6 位之间形成脱水连接。琼脂糖链形成螺旋纤维，后者再聚合成半径 20~30 nm 的超螺旋结构。
材料与仪器
DNA 样品 DNA 大小标准品
琼脂糖溶液 电泳缓冲液 溴化乙锭或 SYBR Gold 染色液 凝胶载样缓冲液
琼脂糖凝胶电泳仪 封胶带 微波炉或沸水浴 电源装置 水浴
琼脂糖溶液 电泳缓冲液 溴化乙锭或 SYBR Gold 染色液 凝胶载样缓冲液
琼脂糖凝胶电泳仪 封胶带 微波炉或沸水浴 电源装置 水浴
步骤
一、材料
1. 缓冲液和溶液
琼脂糖溶液
电泳缓冲液（常用 1X TAE 或 0.5X TBE)
溴化乙锭或 SYBR Gold 染色液
6X 凝胶载样缓冲液
2. 核酸和寡核苷酸
DNA 样品
DNA 大小标准品
3. 专用设备
琼脂糖凝胶电泳仪
封胶带
微波炉或沸水浴
可以提供 500V 和 200mA 的电源装置
55℃ 水浴
二、方法
1. 用封边带封住塑料托盘开放的两边或清洁干燥的玻璃板的边缘形成一个模具，置一个水平支架上。
2. 配制足量的电泳缓冲液（1X TAE 或 0.5X TBE) 用以灌满电泳槽和配制凝胶。
3. 根据欲分离 DNA 片段大小用电泳缓冲液配制适宜浓度琼脂糖溶液：应准确称量琼脂糖干粉加到盛有定好量的电泳缓冲液的三角烧瓶或玻璃瓶中。
4. 用 Kimwipes 松松地塞住三角烧瓶颈部，如用玻璃瓶一定松松地盖住。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。
5. 用隔离手套或夹子转移三角烧瓶或玻璃瓶到 55℃ 水浴。待熔化的凝胶稍冷却后加入溴化乙锭，终浓度为 0.5 μg/ml。轻轻地旋转以充分混匀凝胶溶液。
6. 琼脂糖溶液正在冷却时，用一个合适的梳子形成加样孔。梳齿的位置应在托盘底面上 0.5~1.0 mm，这样琼脂糖浇灌到托盘时将形成符合要求的加样孔。
7. 浇灌温热的琼脂糖溶液进入模具。
8. 让凝胶溶液完全凝结，室温下 30~45 min。加少量电泳缓冲液于凝胶顶部，小心拔出梳子。倒出电泳缓冲液。轻轻撕去封边胶带，将凝胶安放到电泳槽内。
9. 向电泳槽加入电泳缓冲液，刚好没过凝胶约 1 mm。
10. 混合 DNA 样品和 0.2 倍体积 6X 载样缓冲液。
11. 用微量移液器及一次性吸头，或拉长的巴斯德吸管，或玻璃毛细管将样品混合液缓慢加至浸没凝胶的加样孔内。分子质量标准应分别加至样品孔的左侧和右侧的两个孔内。
12. 关上电泳槽盖，接好电极插头。DNA 应向阳极（红色插头）侧泳动。给予 1~5 V/cm 的电压，其中距离以阳极至阴极之间的测量为准。如电极插头连接正确， 阳极和阴极由于电解作用将产生气泡，并且几分钟内溴酚蓝从加样孔迁移进入胶体内。待溴酚蓝和二甲苯氰 FF 迁移到适当距离后再停止电泳。
13. 当 DNA 样品或染料在凝胶中迁移了足够距离时，关上电源、拔出电极插头和打开电泳槽盖。若凝胶和缓冲液有溴化乙锭即用紫外灯观察凝胶和照相。否则凝胶在含溴化乙锭（0.5 μg/ml) 的水或电泳缓冲液中室温浸染 30~45 min, 或者用电泳缓冲液 1:10000 稀释的 SYBR Gold 贮备液浸染。
1. 缓冲液和溶液
琼脂糖溶液
电泳缓冲液（常用 1X TAE 或 0.5X TBE)
溴化乙锭或 SYBR Gold 染色液
6X 凝胶载样缓冲液
2. 核酸和寡核苷酸
DNA 样品
DNA 大小标准品
3. 专用设备
琼脂糖凝胶电泳仪
封胶带
微波炉或沸水浴
可以提供 500V 和 200mA 的电源装置
55℃ 水浴
二、方法
1. 用封边带封住塑料托盘开放的两边或清洁干燥的玻璃板的边缘形成一个模具，置一个水平支架上。
2. 配制足量的电泳缓冲液（1X TAE 或 0.5X TBE) 用以灌满电泳槽和配制凝胶。
3. 根据欲分离 DNA 片段大小用电泳缓冲液配制适宜浓度琼脂糖溶液：应准确称量琼脂糖干粉加到盛有定好量的电泳缓冲液的三角烧瓶或玻璃瓶中。
4. 用 Kimwipes 松松地塞住三角烧瓶颈部，如用玻璃瓶一定松松地盖住。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。
5. 用隔离手套或夹子转移三角烧瓶或玻璃瓶到 55℃ 水浴。待熔化的凝胶稍冷却后加入溴化乙锭，终浓度为 0.5 μg/ml。轻轻地旋转以充分混匀凝胶溶液。
6. 琼脂糖溶液正在冷却时，用一个合适的梳子形成加样孔。梳齿的位置应在托盘底面上 0.5~1.0 mm，这样琼脂糖浇灌到托盘时将形成符合要求的加样孔。
7. 浇灌温热的琼脂糖溶液进入模具。
8. 让凝胶溶液完全凝结，室温下 30~45 min。加少量电泳缓冲液于凝胶顶部，小心拔出梳子。倒出电泳缓冲液。轻轻撕去封边胶带，将凝胶安放到电泳槽内。
9. 向电泳槽加入电泳缓冲液，刚好没过凝胶约 1 mm。
10. 混合 DNA 样品和 0.2 倍体积 6X 载样缓冲液。
11. 用微量移液器及一次性吸头，或拉长的巴斯德吸管，或玻璃毛细管将样品混合液缓慢加至浸没凝胶的加样孔内。分子质量标准应分别加至样品孔的左侧和右侧的两个孔内。
12. 关上电泳槽盖，接好电极插头。DNA 应向阳极（红色插头）侧泳动。给予 1~5 V/cm 的电压，其中距离以阳极至阴极之间的测量为准。如电极插头连接正确， 阳极和阴极由于电解作用将产生气泡，并且几分钟内溴酚蓝从加样孔迁移进入胶体内。待溴酚蓝和二甲苯氰 FF 迁移到适当距离后再停止电泳。
13. 当 DNA 样品或染料在凝胶中迁移了足够距离时，关上电源、拔出电极插头和打开电泳槽盖。若凝胶和缓冲液有溴化乙锭即用紫外灯观察凝胶和照相。否则凝胶在含溴化乙锭（0.5 μg/ml) 的水或电泳缓冲液中室温浸染 30~45 min, 或者用电泳缓冲液 1:10000 稀释的 SYBR Gold 贮备液浸染。
注意事项
在使用微波炉进行加热溶解的过程中要注意缓冲液蒸发导致胶浓度增高，这时可以加入适量缓冲液补齐浓度。
常见问题
不同浓度的琼脂糖凝胶对核酸的分离效果不一，因此要根据核酸分子大小，选择合适孔径的琼脂糖凝胶。
本实验来源《分子克隆实验指南（第三版）》黄培堂等译。
本实验来源《分子克隆实验指南（第三版）》黄培堂等译。
来源：丁香实验
