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琼脂糖凝胶电泳知多少

丁香园

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琼脂糖凝胶电泳可以:(1)用于 DNA 切胶回收;(2)用于 DNA 分离;(3)用于佐证 DNA 是否重组、质粒等是否切开以及其他分子生物学研究。



实验原理


琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。其分析原理与其他支持物电泳的最主要区别是:它兼有「分子筛」和「电泳」的双重作用。

琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力。但由于其孔径相当大,对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道,现广泛应用于核酸的研究中。

蛋白质和核酸会根据 pH 不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此跑的速度不同,根据这个原理可将其分开。电泳缓冲液的 pH 在 6~9 之间,离子强度 0.02~0.05 为最适。常用 1% 的琼脂糖作为电泳支持物。琼脂糖凝胶约可区分相差 100 bp 的 DNA 片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广。普通琼脂糖凝胶分离 DNA 的范围为 0.2~20 kb,利用脉冲电泳,可分离高达 107 bp 的 DNA 片段。



实验步骤


一、试剂配制


5×TBE 缓冲液:450 mmol/L Tris - 硼酸,10 mmol/L EDTA,pH 值 8.0。使用时将上述储存液稀释 10 倍至 0.5×TBE 缓冲液,可同时作为电泳及制胶用的缓冲液。


二、制胶


1. 根椐制胶量及凝胶浓度,在加有一定量的电泳缓冲液的三角锥瓶中,加入准确称量的琼脂糖粉(总液体量不宜超过锥瓶的 50% 容量)。琼脂糖粉末与 0.5×TBE buffer 的比例(w:v)参考表 1,常用琼脂糖浓度为 0.7~1%。


2. 在锥瓶的瓶口上盖上保鲜膜或牛皮纸,并在膜或纸上扎些小孔,然后在微波炉中加热溶解琼脂糖。加热时,当溶液沸腾后,请戴上防热手套,小心摇动锥瓶,使琼脂糖充分均匀溶解。此操作重复数次,直至琼脂糖完全溶解。


此处内容较多,有部分实验步骤省略,想查看更多详情,请点击【阅读原文】查看。



实验注意事项


  • 5×TBE 缓冲液放置时间过久会沉淀,因此一次性不要配太多。工作用电泳缓冲液为 0.5×TBE 缓冲液,取 5×TBE 缓冲液贮存液稀释,现配现用。


  • 用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须统一。

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