一个完整的表达系统通常包括配套的表达载体和表达菌株。如果是特殊的诱导表达还包括诱导剂,如果是融合表达还包括纯化系统或者Tag检测等等。选择表达系统通常要根据实验目的来考虑,比如表达量高低,目标蛋白的活性,表达产物的纯化方法等。
一、材料
1. 诱导表达材料
(1)LB (Luria-Bertani))培养基
酵母膏 (Yeast extract):5 g
蛋白胨 (Peptone):10 g
NaCl:10 g
琼脂 (Agar):1-2%
蒸馏水 (Distilled water) :1 000 ml
pH 7.0,适用范围:大肠杆菌
(2)IPTG 贮备液:2 g IPTG溶于10 ml 蒸馏水中,0 .22 um 滤膜过滤除菌,分装成1 ml /份,-20 ℃ 保存。
(3)1x 凝胶电泳加样缓冲液:
50 mmol / L Tris -CI (pH 6 .8 )
50 mmol / L DTT
2 % SDS (电泳级)
0.1 % 溴酚蓝
10 % 甘油
2. 大肠杆菌包涵体的分离与蛋白纯化材料
(1 )酶溶法
①裂解缓冲液:
50 mmol / L Tris-CI (pH 8 .0 )
1 mmol / L EDTA
100 mmol / LNaCI
②50 mmol / L 苯甲基磺酰氟(PMSF )。
③10 mg / ml 溶菌酶。
④脱氧胆酸。
⑤1 mg / ml DNase I。
(2 )超声破碎法
①TE 缓冲液。
②2xSDS -PAGE 凝胶电泳加样缓冲液:
100 mmol / L Tris-HCI (pH 8 .0 )
100 mmol / L DTT
4 %SDS
0.2 % 溴酚蓝
20 % 甘油
二、实验方案
1. 外源基因的诱导表达
(1 )用适当的限制性内切核酸酶消化载体DNA 和目的基因。
(2 )按连接步骤连接目的基因和载体,并转化到相应的宿主菌。
(3 )筛选出含重组子的转化菌落,提取质粒DNA 作限制性内切核酸酶图谱,DNA 序列测定,确定无误后进行下一步。
(4 )如果表达载体的原核启动子为PL 启动子,则在30 -32 ℃ 培养数小时,使培养液的OD600达0.4-0.6 ,迅速使温度升至42 ℃ 继续培养3 -5 h ;如果表达载体的原核启动子为tac 等,则37 ℃培养细菌数小时达到对数生长期后加IPTG 至终浓度为1 mmol / L。继续培养3 -5 h 。
(5 )取上述培养液1 ml,1 000 g 离心,1 min,沉淀,加100 uL 聚丙烯酰胺凝胶电泳上样缓冲液后,作SDS -PAGE 检测。
2. 大肠杆菌包涵体的分离与蛋白质纯化
(1 )细菌的裂解
常用方法有:① 高温珠磨法;② 高压匀浆;③ 超声破碎法;④ 酶溶法;⑤ 化学渗透等。前三种方法属机械破碎法,并且方法① 、② 已在工业生产中得到应用,后三种方法在实验室研究中应用较为广泛。下面介绍酶溶法和超声破碎法的实验步骤。
a. 酶溶法。常用的溶解酶有溶菌酶;β-1,3 -葡聚糖酶;β-1,6 -葡聚糖酶;蛋白酶;壳多糖酶;糖昔酶等。溶菌酶主要对细菌类有作用,而其他几种酶对酵母作用显著。
主要步骤为:
① 4 ℃ ,5 000 rpm 离心,15 min ,收集诱导表达的细菌培养液(100 ml )。弃上清,约每克湿菌加3 ml 裂解缓冲液,悬浮沉淀。
② 每克菌加8 uL PMSF 及80uL 溶菌酶,搅拌20 min ;边搅拌边每克菌加4 mg 脱氧胆酸(在冷室中进行)。
③ 37 ℃ ,玻棒搅拌,溶液变得粘稠时加每克菌20 uL DNase I。室温放置至溶液不再粘稠。
b. 超声破碎法。声频为15-20 kHz 的超声波在高强度声能输入下可以进行细胞破碎,在处理少量样品时操作简便,液体量损失较少,同时还可对染色体DNA 进行剪切,大大降低液体的粘稠度。
① 收集1 L 诱导表达的工程菌,40 ℃ ,5 000 rpm 离心,15 min ;弃上清,约每克湿菌加3 mlTE 缓冲液。
② 按超声处理仪厂家提供的功能参数进行破菌;10 000 g 离心,15 min ,分别收集上清液和沉淀。
③ 分别取少量上清和沉淀,加入等体积的2x 凝胶电泳加样缓冲液,进行SDS -PAGE 。
注意事项:超声破碎与声频、声能、处理时间、细胞浓度、菌种类型等因素有关,应根据具体情况掌握;超声波破菌前,标本经3 -4 次冻溶后更容易破碎。
3. 包涵体的分离
蛋白质在细菌中的高水平表达,常形成相差显微镜下可见到的细胞质颗粒,即为包涵体,经离心沉淀后可用Triton-X100 / EDTA 或尿素洗涤,若为获取可溶性的活性蛋白,须将洗涤过的包涵体重新溶解并进行重折叠。
(1)试剂与配制
① 洗涤液I:
0.5 % Triton X -100
10 mmol / L EDTA (pH 8 .0 )
溶于细胞裂解液中。
② 2x凝胶电泳加样缓冲液。
(2)细胞裂解混合物12 000 g 离心,15 min ,4 ℃ ;弃上清,沉淀用9x 洗涤液l 悬浮;室温放置5 min;12 000 g 离心15 min ,4 ℃ ;吸出上清,用100 uL 水重新悬浮沉淀;分别取10 uL上清和重新悬浮的沉淀,加10 uL 2x 凝胶电泳加样缓冲液,进行SDS-PAGE 。
4. 包涵体的溶解和复性
(1)试剂与配制
① 缓冲液I:
1 mmol / L PMSF
8mol /L 尿素
10 mmol / L DTT
溶于前述裂解缓冲液中。
② 缓冲液Ⅱ:
50 mmol / L KH2PO4
1 mmol / L EDTA (pH 8 .0 )
50 mmol / L NaCI
2 mmol / L 还原型谷胱甘肽
1 mmol / L 氧化型谷胱甘肽
③ KOH 和HCI 。
④ 2x凝胶电泳加样缓冲液。
(2)用100 uL 缓冲液I 溶解包涵体;室温放置lh ;加9x缓冲液Ⅱ,室温放置30 min ,用KOH 调pH 到10.7 ;用HCI 调至pH 8 .0 ,在室温放置至少30 min ;1 000 g 离心,15 min ,室温;吸出上清液并保留,用100 uL 2x凝胶电泳加样缓冲液溶解沉淀;取10 uL 上清,加10 uL 2x 凝胶电泳加样缓冲液,与20 uL 重新溶解的沉淀进行SDS-PAGE 。
表达菌株是我们往往最容易忽视的一点。目前绝大多数重要的目的基因都是在大肠杆菌中表达的。不同的表达载体对应有不同的表达菌株,一些特别设计的菌株更有助于解决一些表达难题。