刘宝全
如题,GEPIA分析的基因表达图上面有一个号,这个是代表有统计学意义吗,那么如何得到具体的P值呢?谢谢
huarenqiang5
可以利用survival map工具,输入基因列表和癌症列表,得到每个癌症中每个基因与生存的显著性p值。
土井挞克树
如果是GEPIA分析的话有p值选项的,你需要把选项勾选就可以显示了
loveliufudan
在GEPIA中,通过差异分析来判断基因表达水平的显著性,采用的是经典的t检验或方差分析(ANOVA),具体阈值设置可以在页面上自定义调整。当差异分析结果达到显著性水平后,基因表达图上方的星号会显示出来,但并没有给出具体的P值。
如果需要获取基因的具体差异表达P值,可以在页面上选择"Expression DIY"选项,然后在"DEG analysis"模块中进行分析。在此模块中,用户可以自己上传自己的基因表达数据,选择感兴趣的对比组别,然后进行差异分析,并获得具体的P值。