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基因扩增时候以cDNA为模板,为何扩增出一片弥散的带?

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水稻石头

对大小为3 kb 目的基因设计了引物,使用高保真酶进行扩增。模板使用cDNA,有一个基因扩增出了一片弥散的带,没有清晰的目的条带。这种情况是为什么呢?如何优化?谢谢各位大神帮忙解答!

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4 个回答

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dxywode

有帮助

我也是用cDNA做模板的,没有出现过弥散带的情况,但经常出现非特异性条带。出现弥散带的原因可能是你在做凝胶电泳时电泳液被污染或者是做的胶有问题,也可能是你的cDNA部分降解了,至于降解的原因主要是由于时间和温度。扩增完的东西要立即进行电泳,其次电泳的室温不宜太高时间不要太长,一般最多半个小时左右。另外在扩增过程中,由于气候的缘故,部分PCR仪在室温超过30度后就不能正常工作了,这要看PCR仪的型号,其次是前期的RNA提取的效果不好,或者是提取的RNA已经出现降解导致cDNA模板质量受到影响。

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bamboopiggy

有帮助

感觉是你的cDNA降解了,形成的smear

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天一湖医者

有帮助

其原因往往由于酶量过多或酶的质量 差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多引起。其对策有:减少酶量,或调换另一来源的酶。②减少dNTP的浓度。适当降低Mg2+浓 度。增加模板量,减少循环次数。

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未来9

有帮助

出现弥散带的原因可能是你在做凝胶电泳时电泳液被污染或者是做的胶有问题,也可能是你的cDNA部分降解了,至于降解的原因主要是由于时间和温度。扩增完的东西要立即进行电泳,其次电泳的室温不宜太高时间不要太长,一般最多半个小时左右。另外在扩增过程中,由于气候的缘故,部分PCR仪在室温超过30度后就不能正常工作了,这要看PCR仪的型号,其次是前期的RNA提取的效果不好,或者是提取的RNA已经出现降解导致cDNA模板质量受到影响。

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