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目前在做基因克隆,P不出来条带的原因有什么呢?有时候会出现非特异性扩增,但是不能重复?

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dxy_x2e9f5h5

目的片段大概1100多bp


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5 个回答

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sswei

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引物可能有问题,另外,可能PCR的条件不对,退火的温度太低了导致非特异性扩增。

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z流沙z

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1100bp应该还是相对好pcr的,关键在于引物设计和模板表达量。看图可能引物还需优化一下,二聚体有点多。模板可以在ncbi上面找一个表达量相对较高的组织或者细胞。

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毛利小五郎的徒弟

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大概率是引物不合适,引物不合适pcr就不容易出条带,非特异性扩增也和引物有关系

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Dr_劉医生

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可能的原因:一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数过多有关。

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loveliufudan

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有几种可能的原因导致无法从PCR反应中得到预期大小的克隆条带:

模板DNA的质量不佳:如果DNA的质量不好,如有降解、受到污染或稀释不当,可能会影响PCR扩增。可以尝试重新提取DNA并进行质检。

引物设计问题:引物的设计可能存在问题,如引物序列不准确、杂交不充分等。可以重新设计引物或者尝试使用已经发表的引物进行扩增。

PCR条件不合适:PCR条件可能需要进行优化,如反应温度、延伸时间、Mg2+浓度、引物浓度等。可以尝试进行温度梯度PCR或其他条件优化方法。

酶的质量或浓度问题:酶的质量或浓度不佳也可能会导致PCR扩增不成功。可以尝试更换酶或调整酶的浓度。

目的片段长度过长:目的片段长度过长可能会影响PCR扩增效率,可以尝试将反应分为两步,或者进行限制性内切酶消化或重组技术。

样品的异质性:如果样品中存在多个异质体或者多个位点,可能会导致PCR扩增的非特异性。可以尝试进行克隆纯化或者PCR产物测序以确定正确的目的片段。

非特异性扩增出现的可能原因也与上述几点类似。无法重复的原因可能是由于实验条件或样品不同导致的。建议尝试优化PCR反应条件,重新设计引物或使用其他方法来确定目的片段。

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