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单细胞样本如何整理成一个文件?

相关实验:单细胞测序数据分析

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怪兽牙好白

GEMO数据库h5单细胞测序,在合并不同样本时用harmony函数一直报错:Error in `.SelectFeatures()`:

! None of the features provided are present in the feature set

Backtrace:

1. scRNA_harmo %>% ...

3. Seurat:::FindVariableFeatures.Seurat(...)

5. Seurat:::FindVariableFeatures.StdAssay(...)

7. SeuratObject:::VariableFeatures.Assay5(...)

9. SeuratObject:::.SelectFeatures.list(...)


用的是R语言。

scRNA_harmo %>% FindVariableFeatures(.,selection.method = "vst", nfeatures = 2000),就是这句代码报错。

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