单细胞测序悬液老是制备失败?别担心,单细胞核测序来拯救你的样本了
上海吉凯基因医学科技股份有限公司
虽然单细胞测序到现在已经应用到各个研究领域,但是实际的实验过程中依然会遇到很多问题,比如:
1.很多样本根本没有办法制备单细胞悬液,比如已经在-80℃冻存的样本;
2.有些样本制备成单细胞悬液以后现有的单细胞测序平台无法捕获,比如心肌细胞、骨骼肌细胞、成熟的脂肪细胞等,由于直径过大,超出了10x genomics和BD Rhapsody平台最大能捕获的细胞直径;
3.再者有些细胞类型可能在单细胞悬液制备的过程中丢失,比如脑部的新生神经元、肾脏的肾小球足细胞和肾小球系膜细胞等都会在单细胞悬液制备的过程中丢失
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问题太多,都愁得小伙伴们辗转反侧,别急别急,单细胞核测序来拯救你的样本了,其实之前小编已经做过一期技术介绍,告诉小伙伴们单细胞测序和单细胞核测序该怎么选择,感兴趣的小伙伴可以再看看:
选择困难怎么办?一文教你如何快速锁定单细胞核测序or单细胞测序!
肯定还是有很多小伙伴担心,这个技术到底行不行啊,有没有人用啊,我的样本很珍贵的…..小编用snRNA-seq在pubmed上做了检索,一共有62篇文献,其中有51篇是2020年和2021年发表的,这说明单细胞核测序越来越多的被应用到各种研究中。
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这篇文章对17名死于COVID-19的人进行临床解剖时收集了11个器官的组织,形成了一个约有420个标本的组织库。通过对肺、肾、肝和心脏等组织的单细胞测序(sc-RNA-seq)和单细胞核测序(snRNA-Seq),得到了SARS-CoV-2感染后不同组织全面的单细胞图谱;可见单细胞核测序已经被运用于各种不同的组织类型。
目前吉凯已经积累了各种不同类型样本的单细胞核测序(snRNA-seq)经验,并且在单细胞核抽提方面也是一如既往的发挥了吉凯强大且专业的单细胞样本制备能力,如下图所示的一些冻存样本的核悬液制备结果:
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单细胞核测序初步质控结果
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单细胞核测序UAMP降维结果
吉凯基因凭借多年在靶标筛选及验证服务领域的技术积累,建立的标准化 、工程化 、系统化的GRP平台,为中国研究型医生提供科研服务,加快科研成果转化,其中,单细胞测序拥有10x和BD两个平台,提供单细胞RNA-seq、单细胞核测序、单细胞混样RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞(RNA+ATAC)、空间转录组测序等服务。