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DAVID做GO富集

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夜雨声烦_snsy

为什么结果FDR出来全是1

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3 个回答

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汤姆卜丽波

有帮助

全是1没有变化么。那肯定是你的参数设置错了,你去筛选的是差异基因吧,然后做GO富集,先按照默认参数跑一边

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土井挞克树

有帮助

说明pval太大了,矫正后全变成不显著了。fdr用于多重假设研究中矫正p值,排除假阳性,相当于把当前pval放大。

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loveliufudan

有帮助

可能是因为您选择的基准数据集过于宽泛,包含了过多的基因或蛋白质,导致计算的FDR值很小。

为了解决这个问题,您可以考虑使用更加严格的基准数据集进行分析,如使用只包含您研究物种中已知基因或蛋白质的数据集作为基准数据集。此外,您还可以尝试使用其他的GO分析工具,如GSEA、Enrichr等,来进行GO富集分析,以获得更加准确和可靠的结果。

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