免疫细胞marker标记及panel确定

如果你主要分析肿瘤样本中的免疫细胞群体，建议肿瘤组织研磨后percoll一下，下层70%，上层40%，离心后最上层是肿瘤细胞，中间是淋巴细胞，底部是死细胞。然后在去测淋巴细胞的胞内因子准一些。如果只染表面，可以不用percoll，但染色封闭处理一下对巨噬及DC等要好一些。

细胞标志物（Marker）是我们用来对细胞定义和分选的重要标志，特别是随着单细胞测序技术的普及，当我们对组织内的细胞进行检测并进行TSNE聚类后，特异性表达某些基因的这类细胞有什么特性？或者我要看一下上皮/内皮/B细胞/T细胞/干细胞/成纤维细胞等不同类型细胞的Marker的表达情况，细胞的Marker基因是一个列表或者数据库告诉我们哪些细胞的标志物/基因是什么，就是panel确定了。

不同的肿瘤组织处理的方式不一样，主要是肿瘤组织是需要进行酶消化的过程，因此需要根据肿瘤的不同类型进行选择：不同免疫细胞的panel确定后，想减少好批次间的差异那么对于仪器的要求其实是比较严格的，可以建立仪器标准化的方案，做好仪器质控，检测仪器的变化，再可允许的变化范围后，再上样本检测，这样尽量保证由于仪器所带来的批间差