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求助|在NCBI下载sra数据失败怎么处理

相关实验:生物信息学数据库和软件的搜索实验

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鱼尾游游

有的序列号运行好,可以下载好fastq后缀的文件,但是有的序列号就这样了,也不知道咋回事,是不是要下载一个error report看看,这要在哪里下载,界面上的error report好像只是说明而已,求大佬指点迷津,万分感谢😭

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3 个回答

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dxy_q7ghmr15

有帮助

网络,内存,输入/搜索项。

刷新重新进,清理缓存

官方渠道下载,问导师

希望可以起到帮助作用。

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loveliufudan

有帮助

可以尝试以下方法:

检查网络连接:首先,请确保您的网络连接是正常的。可以尝试重新连接网络或者使用其他网络连接。

使用SRA Toolkit:SRA Toolkit是一款由NCBI提供的下载和处理SRA数据的工具。您可以下载并安装SRA Toolkit,然后使用命令行工具下载SRA数据。具体操作可以参考SRA Toolkit官方文档。

查看Error Report:如果下载失败,您可以尝试查看Error Report来了解具体失败的原因。Error Report中会列出下载的错误信息和可能的原因。您可以通过NCBI网站上的“Download Error Report”链接来下载Error Report。

尝试使用其他下载工具:如果您仍然无法下载SRA数据,可以尝试使用其他下载工具。例如,您可以使用wget或curl等命令行工具,或者使用基于图形界面的下载工具,如Aspera Connect等。

需要注意的是,SRA数据较大,下载可能需要一定时间和网络带宽。如果您使用的是命令行工具,可以尝试使用多线程下载来加快下载速度。

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

删掉重新下载,如果还打不开就把软件重新安装

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