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seer数据库使用疑问

相关实验:生物信息学数据库和软件的搜索实验

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serahd

首先我下载的时候,就出现了bug,上面写 IPersistFile::save 失败;代码 0x80070005 .拒绝访问”;

然后之前可以上,但从今天开始上去就直接说我的数据库连接不上,让我寻找新的数据库,一直连接就是connection timed out,求问丁香园大神,怎么解决这个问题

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3 个回答

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huarenqiang5

有帮助

建议按以下步骤试试:

官网地址:https://seer.cancer.gov/

数据库的使用权限

1.进入官网,【SEER Data&Software】<【How to Request Data Access】

2.点击【Continue to Request Form】

3.机构账户点击左边,非机构账户填写好邮箱后点击右边。

4.出现申请页面:信息填写好后点击【Sumbit】,之后 SEER 会发一封邮件到你注册的邮箱,点击链接:

5.出现相关页面,信息填写好后点击【Sumbit】,之后 SEER 会发封邮件到你注册的邮箱,点击链接下载SEEundefinedStat:

6.点击链接,出现相关页面,信息填写好后点击【Request Download】,之后 SEER会发3封邮件到你注册的邮箱,分别是SEEundefinedStat下载地址,还有软件登录的账户密码。


软件常用功能介绍

使用前,记得先登录,账号密码就是前面申请的。点击红框指示的表格按钮,也就是【case listing session】,此时需要输入账号密码。


数据的提取与导出


【Data】指的是你选择的是哪个数据库。因为软件每年都会更新,所以会有好个文件,一般选择最上面的那个。


第二栏【selection】就是选择病例筛选的条件。如我们纳入 2019-2015 年的肺癌病人。点击edit,1表示的是诊断年份,2表示的是肿瘤部位,然后选择【lung and bronchus】,或者我们可以使用【Find】按键进行搜索。


【Table】指的是导出的数据要呈现哪些内容,也就是选择你需要的临床信息。可选择的内容有很多,根据文章需要的变量进行选择。

【Output】指的是输出文件的文件名。可以随便命名,如【Lung】,点击下图的闪电按钮,即可输出想要的文件。最后将表格的数据直接复制粘贴到excel里,数据就提取结束了。最后导出来的数据大家可以用极智分析平台进行统计分析了。

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loveliufudan

有帮助

对于第一个问题,这可能是由于您没有足够的权限来保存下载的文件。您可以尝试使用管理员权限重新启动计算机,并尝试再次下载并保存SEER数据库文件。或者,您还可以尝试将文件保存到另一个位置,例如桌面或根目录,看看是否可以成功保存。

对于第二个问题,这可能是由于SEER数据库服务器不可用或存在网络问题。您可以尝试等待一段时间,然后再尝试连接。如果问题仍然存在,请确保您的网络连接正常,并尝试使用其他浏览器或计算机连接SEER数据库。如果仍然无法连接,您可以联系SEER数据库管理员或技术支持人员寻求帮助。

另外,SEER数据库更新频繁,建议您在使用前确认您下载的数据库是否是最新版本。您可以访问SEER数据库官网获取更多信息和帮助。

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

先检查一下使用权限是否到期了,然后重新卸载再进入

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