没有明确关系，Holliday交叉识别蛋白是着丝粒特异性的伴侣蛋白，参与着丝粒和动粒的募集与组装、DNA双键断裂修复。 而holliday模型是关于遗传重组机制的模型。

Holliday junction即Holliday交叉，是1964年Robin Holliday为解释同源重组而提出的Holliday模型中，DNA分子四条单链之间相互交叉所形成的一个中间结构。同源重组时，两个配对的DNA双螺旋同源链的相应位点产生单链断裂，切口产生的游离末端可以移动，每条链都脱离其配对的链并交叉与另一双股螺旋中的互补链配对。这种被连接在一起的双链称为结合分子（joint molecule）,其交叉就是Holliday交叉（如图）。

Holliday模型的提出是为了解释子囊菌中的基因重组中基因转变的现象。

具体情况可以参考一下这篇文献《hollliday交叉》。

hollliday交叉识别蛋白和holliday模型没有关系，这个蛋白具有多种功能，调节有丝分裂只是一方面。