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如何设计Keap1基因的MSP或BSP引物

相关实验:DNA 甲基化分析

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dxy_hma3qv09

如何设计Keap1基因的MSP或BSP引物

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2 个回答

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土井挞克树

有帮助

(1)将启动子序列中非CG二核苷酸的C全部转化为T(word可实现此功能);
(2)序列载入premier5,按上述原则筛选引物。
(3)MSP引物中的一条往往是由需要确定,因此我们可以直接利用premier5筛选其互补引物。

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huarenqiang5

有帮助

(1)引物结合位点应该在原始序列中包含4个以上胞嘧啶来确保转化后的DNA的特异性。

(2)BSP引物不应包含CG二核苷酸,长度在25-30bp较为合适;MSP引物因为往往具有较高的GC比,长度应适当缩短。

(3)扩增片段一般认为不要超过650bp,以保证PCR的效率。

(4)对于MSP引物,应该包含3-5个潜在可甲基化位点,且引物的3端应该是一个潜在的可甲基化胞嘧啶,以得到最大化的特异性。

(5)MSP中,U引物与M引物应该具有接近的TM值。

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