ChIP实验中需要选择ChIP级别抗体，没有ChIP级别抗体该怎么选择？如果我的实验种属比较特殊（果蝇，昆虫，植物等）该怎么选择

实在没有的话，可以联系公司订制，但时间比较长，急的话，可以拿IP/IHC/ICC级别的抗体进行尝试

首先，利用 CiteAb（http://www.citeab.com/）网站去查询，是否有市售商业化抗体。例如 Application 选择 ChIP，出现的 45 个抗体都是经过文献验证做过 ChIP 的。值得注意的是，这里的抗体也有 ChIP 和 ChIP-seq 之分，后者拥有更好的信噪比。若有，那么恭喜您，您离成功近了一步，但是需要注意的是，2011 年 Nat Struct Mol Biol 中曾对 ChIP 级别的抗体进行试验，结果只有 78% 的 ChIP 级别的抗体具有良好的特异性，同时，即使同一货号 ChIP 级别抗体，因批次的不同可能也会造成结果的差异。所以，当我们获得相应抗体时，一些相关的验证工作也是必不可少的。如果没有 ChIP 级别的抗体，又该如何呢？一种选择是制备抗体，但是不一定在 ChIP 实验里有良好的表现，只能进行尝试。另外一种解决办法就需要今天的主角登场-----标签抗体，原理就是进行目的蛋白和标签蛋白融合表达，随后利用标签特异性抗体获得目的蛋白-DNA 复合物。

但是由于ChIP级别（ChIP验证）过的抗体数量非常有限，所以当没有ChIP级别抗体时，我们有如下3种方法可以考虑：

1选择IP/IHC/ICC进行尝试，一般在这些实验中抗体对蛋白的识别结构是native，和ChIP抗体识别结构较为相似；不建议尝试Western blot抗体，因为WB抗体识别的蛋白结构多是denature，并不适合ChIP实验；

2将蛋白的序列放在NCBI上进行Blast，如果蛋白序列同源性与其他种属或物种蛋白超过80%，可以尝试跨物种抗体；

3可以使用标签抗体