转录组学分组问题请教

请问，想要研究两组间差异的转录组，每组需要设置几个样本？跟对照组3 VS 处理组3不一样，我是选取临床收集的3个耐药菌和3个敏感菌，这样样本量是否达标？这种设置与 对照组3 VS 处理组3 不一样吧？会不会因为3个耐药菌来源不一样，导致组内差异过大，需要更多样本？引起审稿人质疑。求解答，谢谢。如果不行，需要几个样本